@XiongApple 可以cor.test()
【R語言編程】---根據(jù)表達(dá)量計算mRNA與lncRNA的皮爾森相關(guān)系數(shù)前言:在構(gòu)建ceRNA 網(wǎng)絡(luò)時易核,需要計算lncRNA 與 蛋白編碼gene (pc gene) 間的表達(dá)相關(guān)性,一般采用皮爾遜相關(guān)系數(shù)娘荡。具體如何做呢循榆? 首先獲得lncRNA...
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【R語言編程】---根據(jù)表達(dá)量計算mRNA與lncRNA的皮爾森相關(guān)系數(shù)前言:在構(gòu)建ceRNA 網(wǎng)絡(luò)時易核,需要計算lncRNA 與 蛋白編碼gene (pc gene) 間的表達(dá)相關(guān)性,一般采用皮爾遜相關(guān)系數(shù)娘荡。具體如何做呢循榆? 首先獲得lncRNA...
如果lncrna和mrna不在同一數(shù)據(jù)集中队丝,樣本量不同該怎么辦
【R語言編程】---根據(jù)表達(dá)量計算mRNA與lncRNA的皮爾森相關(guān)系數(shù)前言:在構(gòu)建ceRNA 網(wǎng)絡(luò)時局骤,需要計算lncRNA 與 蛋白編碼gene (pc gene) 間的表達(dá)相關(guān)性虾宇,一般采用皮爾遜相關(guān)系數(shù)鹃愤。具體如何做呢簇搅? 首先獲得lncRNA...
一、miRNA的一般研究策略 miRNA也稱微RNA意述、microRNA提佣,是真核生物中廣泛存在的一種長度為21-23nt的RNA分子,可通過與mRNA的結(jié)合荤崇,抑制mRNA的轉(zhuǎn)錄...
轉(zhuǎn)錄組測序的最直接目的,就是設(shè)法尋找組間顯著表達(dá)變化的基因喧兄,解釋基因表達(dá)水平的變化對生物功能的影響无畔。例如啊楚,腫瘤患者與正常人群相比哪些編碼蛋白或非編碼RNA分子發(fā)生了失調(diào),這些...
一文看懂PCA主成分分析中介紹了PCA分析的原理和分析的意義(基本簡介如下颜价,更多見博客),今天就用數(shù)據(jù)來實(shí)際操練一下诉濒。 在生信寶典公眾號后臺回復(fù)“PCA實(shí)戰(zhàn)”周伦,獲取測試數(shù)據(jù)。...
@NiKasu 好的,學(xué)到了片排,感謝大佬
12.GEO數(shù)據(jù)集的R語言差異分析和代碼解析—1.數(shù)據(jù)下載和整理一寨腔、舉例介紹 本節(jié)下載GSE1009數(shù)據(jù)集,使用limma包進(jìn)行差異分析舉例划纽。 GSE1009 樣本量:共6個樣本脆侮,其中3個為糖尿病腎病(DN)腎小球樣本,另3個為正常腎小球...
一幻捏、舉例回顧 本節(jié)下載GSE1009數(shù)據(jù)集,使用limma包進(jìn)行差異分析舉例命咐。 GSE1009 樣本量:共6個樣本篡九,其中后3個為糖尿病腎病(DN)腎小球樣本,前3個為正常腎小...