@XiongApple 可以cor.test()
【R語(yǔ)言編程】---根據(jù)表達(dá)量計(jì)算mRNA與lncRNA的皮爾森相關(guān)系數(shù)前言：在構(gòu)建ceRNA 網(wǎng)絡(luò)時(shí)狮斗，需要計(jì)算lncRNA 與 蛋白編碼gene (pc gene） 間的表達(dá)相關(guān)性较木，一般采用皮爾遜相關(guān)系數(shù)供炼。具體如何做呢箍土？ 首先獲得lncRNA...
如果lncrna和mrna不在同一數(shù)據(jù)集中，樣本量不同該怎么辦
【R語(yǔ)言編程】---根據(jù)表達(dá)量計(jì)算mRNA與lncRNA的皮爾森相關(guān)系數(shù)前言：在構(gòu)建ceRNA 網(wǎng)絡(luò)時(shí)井辆，需要計(jì)算lncRNA 與 蛋白編碼gene (pc gene） 間的表達(dá)相關(guān)性借跪，一般采用皮爾遜相關(guān)系數(shù)。具體如何做呢愧薛？ 首先獲得lncRNA...
一货邓、miRNA的一般研究策略 miRNA也稱微RNA、microRNA四濒，是真核生物中廣泛存在的一種長(zhǎng)度為21-23nt的RNA分子换况，可通過與mRNA的結(jié)合，抑制mRNA的轉(zhuǎn)錄...
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的最直接目的，就是設(shè)法尋找組間顯著表達(dá)變化的基因嗓蘑，解釋基因表達(dá)水平的變化對(duì)生物功能的影響须肆。例如，腫瘤患者與正常人群相比哪些編碼蛋白或非編碼RNA分子發(fā)生了失調(diào)桩皿，這些...
一文看懂PCA主成分分析中介紹了PCA分析的原理和分析的意義(基本簡(jiǎn)介如下，更多見博客)梅尤，今天就用數(shù)據(jù)來實(shí)際操練一下柜思。 在生信寶典公眾號(hào)后臺(tái)回復(fù)“PCA實(shí)戰(zhàn)”，獲取測(cè)試數(shù)據(jù)巷燥。...
@NiKasu 好的缰揪，學(xué)到了陨享，感謝大佬
12.GEO數(shù)據(jù)集的R語(yǔ)言差異分析和代碼解析—1.數(shù)據(jù)下載和整理一、舉例介紹 本節(jié)下載GSE1009數(shù)據(jù)集钝腺，使用limma包進(jìn)行差異分析舉例抛姑。 GSE1009 樣本量：共6個(gè)樣本，其中3個(gè)為糖尿病腎病(DN)腎小球樣本艳狐，另3個(gè)為正常腎小球...
一、舉例回顧 本節(jié)下載GSE1009數(shù)據(jù)集镀虐，使用limma包進(jìn)行差異分析舉例箱蟆。 GSE1009 樣本量：共6個(gè)樣本，其中后3個(gè)為糖尿病腎病(DN)腎小球樣本刮便，前3個(gè)為正常腎小...
