![240](https://upload.jianshu.io/users/upload_avatars/25496435/bb10b59c-82a7-4935-af74-36d7f6c85708.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
導讀 前面已經(jīng)介紹了獲取菌屬相對豐度表的方法籍茧,以及多樣性分析中的基本概念和計算方法曲管。接下來將開始介紹一種尋找組間差異細菌的常用方法LEfSe。LEfSe(Linear dis...
導讀 Bray-Curtis NMDS降維分析菌群結構场斑。 一、輸入數(shù)據(jù) 1.1 菌屬豐度矩陣 1.2 樣品分組 二牵署、BC NMDS函數(shù) 三漏隐、分析及結果 3.1 結果文件 3....
先上圖 注:填充顏色由AI處理。 (樣本和分組文件如下)(這里只是展示數(shù)據(jù)形式并不是原數(shù)據(jù)(分組名與代碼中不一樣)) vegan分析數(shù)據(jù) 行名樣本奴迅,列名物種青责,內容豐度。 繪圖...