![240](https://upload.jianshu.io/users/upload_avatars/25496435/bb10b59c-82a7-4935-af74-36d7f6c85708.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
導(dǎo)讀 前面已經(jīng)介紹了獲取菌屬相對(duì)豐度表的方法,以及多樣性分析中的基本概念和計(jì)算方法跃惫。接下來(lái)將開(kāi)始介紹一種尋找組間差異細(xì)菌的常用方法LEfSe叮叹。LEfSe(Linear dis...
導(dǎo)讀 Bray-Curtis NMDS降維分析菌群結(jié)構(gòu)霉翔。 一、輸入數(shù)據(jù) 1.1 菌屬豐度矩陣 1.2 樣品分組 二苞笨、BC NMDS函數(shù) 三债朵、分析及結(jié)果 3.1 結(jié)果文件 3....
先上圖 注:填充顏色由AI處理。 (樣本和分組文件如下)(這里只是展示數(shù)據(jù)形式并不是原數(shù)據(jù)(分組名與代碼中不一樣)) vegan分析數(shù)據(jù) 行名樣本瀑凝,列名物種序芦,內(nèi)容豐度。 繪圖...