240 發(fā)簡(jiǎn)信
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    16S測(cè)序分析(三)用LEfSe尋找組間差異細(xì)菌

    導(dǎo)讀 前面已經(jīng)介紹了獲取菌屬相對(duì)豐度表的方法,以及多樣性分析中的基本概念和計(jì)算方法跃惫。接下來(lái)將開(kāi)始介紹一種尋找組間差異細(xì)菌的常用方法LEfSe叮叹。LEfSe(Linear dis...

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    R:Bray-Curtis NMDS

    導(dǎo)讀 Bray-Curtis NMDS降維分析菌群結(jié)構(gòu)霉翔。 一、輸入數(shù)據(jù) 1.1 菌屬豐度矩陣 1.2 樣品分組 二苞笨、BC NMDS函數(shù) 三债朵、分析及結(jié)果 3.1 結(jié)果文件 3....

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    非度量多維尺度(NMDS)分析及R繪圖

    先上圖 注:填充顏色由AI處理。 (樣本和分組文件如下)(這里只是展示數(shù)據(jù)形式并不是原數(shù)據(jù)(分組名與代碼中不一樣)) vegan分析數(shù)據(jù) 行名樣本瀑凝,列名物種序芦,內(nèi)容豐度。 繪圖...

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