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首先非常感謝Cj大神開發(fā)出來的TBtools生信工具，為生信分析做圖帶來了極大的便利衅胀。作為生信小白岔乔，在做多物種間共線性分析時(shí)，嘗試了多種方法滚躯，苦于沒有計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)雏门，一直沒能完成...

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寫在前面 對于沒有做過共線性分析的小伙伴呼盆，可以通過以下幾段內(nèi)容聂使，了解一下，我為什么要費(fèi)勁巴拉畫出這樣一張圖睡汹。 除了基因組成的相似性,在不同基因組中基因排列順序的一致性更能夠體...

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文獻(xiàn)：REVIGO Summarizes and Visualizes Long Lists of Gene Ontology Terms 發(fā)表年份：Received Mar...

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全文分析流程學(xué)習(xí)按照：九月學(xué)徒ChIP-seq學(xué)習(xí)成果展 一告私、 怎么將SAR文件轉(zhuǎn)為fastq文件？ 1. 【方法】利用軟件sratoolkit，下載后解壓况脆，找到其中的 f...

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前期的到的基因表達(dá)量矩陣格了，可以得到每個(gè)基因的表達(dá)量看铆，然而由于我們在做實(shí)驗(yàn)過程中的重復(fù)（包括技術(shù)重復(fù)與生物學(xué)重復(fù)）理論上來講是可以保持表達(dá)量在重復(fù)中的一致性。因此我們也可通過這...

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今天是不用學(xué)代碼利用生信軟件聯(lián)合“點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)”就可以取得hub基因的“白癡”實(shí)操盛末，趕快點(diǎn)起來～ Hub基因（關(guān)鍵基因）是在生物學(xué)過程中發(fā)揮重要作用的基因弹惦，它往往在通路中為主導(dǎo)地位...

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之前有一次，我導(dǎo)說“能不能把這些基因按順序畫在果蠅的染色體上”悄但，因此棠隐，我尋找了一些實(shí)現(xiàn)這個(gè)需求的方法。經(jīng)過一番奇奇怪怪的操作之后檐嚣，最終用ggplot2畫了助泽。。嚎京。其它方法簡單地...

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需求：下載DNA損傷修復(fù)相關(guān)的基因列表嗡贺。 第一步 搜索數(shù)據(jù)庫 進(jìn)入GO (Gene Ontology) 數(shù)據(jù)庫網(wǎng)頁 http://geneontology.org/ ，在搜索...

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01 什么是全基因組復(fù)制 多倍化（polyploidy）或全基因加倍/復(fù)制（whole genome duplication, WGD）事件是指基因組內(nèi)的所有序列都發(fā)生重復(fù)架谎，...

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放一張效果圖辟躏，這些谷扣，三四年前的東西，我其實(shí)一直懶得說捎琐。 寫在前面 “Gene Structure View (Advanced)”這個(gè)功能可以說会涎，也是一時(shí)興起寫出來的。開發(fā)的...

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前言：進(jìn)行RNA-seq入門實(shí)戰(zhàn)首先需要有一定的linux與R基礎(chǔ)瑞凑，推薦跟著B站生信技能樹-jimmy老師學(xué)習(xí)打牢基礎(chǔ)：【生信技能樹】生信人應(yīng)該這樣學(xué)linux(更新至第14...

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測序行業(yè)的蓬勃發(fā)展籽御，帶來微生物組學(xué)日新月異的變化练慕。目前惰匙，單一組學(xué)的文章不斷“貶值”，前沿研究的目光從單一組學(xué)逐步拓展至多組學(xué)對貫穿分析铃将，即結(jié)合多個(gè)組學(xué)的分析角度项鬼，從多個(gè)層面闡...

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1劲阎、fastq文件 一般我們從公司里得到的原始測序數(shù)據(jù)都是屬于fastq.gz文件, .gz是一種壓縮格式的縮寫绘盟，于是首先第一步是對這些壓縮格式進(jìn)行解壓操作 解壓好的文件即正...