計(jì)算每個(gè)位點(diǎn)的多態(tài)性； vcftools --vcf test.vcf --site-pi --positions SNP_list.txt --out out.txt...
IP屬地：北京
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vcftools 計(jì)算 pi浸须、fst、tajima's D
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2019-03-06 Mac 復(fù)制快捷鍵失效問題Mac 復(fù)制快捷鍵失效問題 最近忽然發(fā)現(xiàn)點(diǎn)按 ?C 有時(shí)候無法進(jìn)行進(jìn)行復(fù)制，狂按幾次菜單欄中的“編輯”部分才會(huì)變藍(lán)…… 開始以為是我的 Mac 按鍵失靈了，但仔細(xì)試了一下，發(fā)...
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潛在因素混合模型：LFMM—— R包lfmm在自然群體（區(qū)別于強(qiáng)人工選擇）中，如果我們感興趣的數(shù)量性狀表現(xiàn)出與特定的地理環(huán)境變量有高度的關(guān)聯(lián)性爱沟，隨著環(huán)境變量的改變而變化，則這些環(huán)境變量往往反映了環(huán)境作用于個(gè)體表型的選擇...
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入門流程 | 三代測(cè)序基因組從[ 組裝 ]到[ 評(píng)估 ]- Pacbio匆背、Flye呼伸、Quast寫在前面 最近，帶一個(gè)師妹了解并做了簡(jiǎn)單的基因組組裝工作钝尸，感覺其上手速度還可以括享。慢慢地有初窺生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析門徑的樣式，于是....還是鼓勵(lì)她整理整理流程珍促，分享分享（其實(shí)....
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Biopython之gbff轉(zhuǎn)gff格式 2020-04-27gbff是NCBI基因組數(shù)據(jù)庫常見的基因組genebank格式文件铃辖，在實(shí)際分析中，常常需要gff格式或者gtf格式猪叙，所以就存在gbff轉(zhuǎn)換gff格式的需求image.png ...
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這或許是我寫的最全的BLAST教程Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等....
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conda安裝bioperl模塊之后還是不能調(diào)用其中的模塊
我第一次遇到這種情況的時(shí)候娇斩，在網(wǎng)上查了很多的教程，試過各種方法穴翩，以及重新安裝相應(yīng)的模塊還是不能解決犬第，在各種折磨之后終于找到了原因。 查看conda安裝bioperl后的存儲(chǔ)的...
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使用pyGenomeTracks繪制表觀展示圖pyGenomeTracks是什么 首先在介紹pyGenomeTracks之前芒帕， 先說幾個(gè)常用的表觀組學(xué)數(shù)據(jù)展示工具瓶殃，IGV，UCSC和WashU副签。其中大家用的最多的應(yīng)該就是...
