這里是佳奧绍绘！ 這里記錄一些我使用GSAman 的心得击吱。 1捉蚤、.gsaman文件 選擇一個.gff3文件，直接修改文件后綴為.gff3.gsaman 把修改后綴的文件拖入即可尉桩，...
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【GSAman 使用記錄】
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「基因組」著絲粒和端粒鑒定軟件
最近狀態(tài)不佳，連續(xù)兩件事情做的時候只想到了一半完丽，做了又等于沒做躲惰，都成了自己預(yù)想的最差的結(jié)果，要想做到最佳智袭，只有重做奔缠，現(xiàn)在浪費時間結(jié)果不合適等于白做。一心多用补履，今天白搞一下午添坊，...
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Java常見幾種動態(tài)代理實現(xiàn)方式
一、四種方式 JDK動態(tài)代理：運行期動態(tài)的創(chuàng)建代理類箫锤，只支持接口贬蛙。 ASM：一個 Java 字節(jié)碼操控框架。它能夠以二進制形式修改已有類或者動態(tài)生成類谚攒。不過ASM在創(chuàng)建cla...
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JavaMail實現(xiàn)注冊郵箱驗證案例在日常生活中阳准，我們在一個網(wǎng)站中注冊一個賬戶時，往往在提交個人信息后馏臭，網(wǎng)站還要我們通過手機或郵件來驗證野蝇，郵件的話大概會是下面這個樣子的： 用戶通過點擊鏈接從而完成注冊，然后才能...
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NGS 數(shù)據(jù)質(zhì)控軟件—fastp陳實富博士編寫的 fastp 軟件能實現(xiàn) FASTQ 數(shù)據(jù)自動化過濾括儒、剪裁绕沈、錯誤校正等功能，因其多樣的功能和高效的速度受到了許多用戶的歡迎帮寻，已成為 NGS 質(zhì)控領(lǐng)域不可或缺的...
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利用OGDRAW繪制葉綠體圈圖＋Geneious長度的統(tǒng)計組裝并注釋完葉綠體基因組后乍狐，就要進行圈圖的繪制。這里使用在線網(wǎng)站OGDRAW來繪制圈圖固逗。 主要參考教程：葉綠體基因組注釋浅蚪、圈圖繪制~ CPGAVAS2藕帜，OGDRAW（圖文教程...
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BUSCO 做基因組評價Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs (BUSCO)是用于評估基因組組裝和注釋的完整性的工具。在相近的物種之間總有一些保守...
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基因注釋：基于SNAP+Augustus+GeneMark的maker3 pipeline
我使用的maker版本為3.01.04 第一輪：將已知基因比對到基因組 包括兩個部分：??屏蔽重復(fù)序列??將已知的轉(zhuǎn)錄組/蛋白序列與基因組進行比對 1.（可選）構(gòu)建自定義重復(fù)序列...
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單細胞自動注釋與手動注釋
https://mp.weixin.qq.com/s/Lbta92hfUXgL_Yi0M9YjZw[https://mp.weixin.qq.com/s/Lbta92hfUX...
