##20220423 ESCC_marker plasma： IGHG3蔓倍、IGHG1苇经、MZB1 JCHAIN B： CD79A、MS4A1视事、IGHM绽昏、CD19脑融、CD79A虏劲、C...
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單細(xì)胞marker整理
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TCGA 數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn) —— GSVA、ssGSEA 和單基因富集分析前言 前面演闭，我們介紹過了差異基因的功能富集分析不跟，今天，我們對(duì)這部分的內(nèi)容作一些補(bǔ)充 主要介紹一下 GEVA米碰、ssGSEA 和單基因的富集分析 GSVA 我們知道窝革，GSEA 富...
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R繪圖應(yīng)用實(shí)例：成組的t檢驗(yàn)及繪圖本文主要是利用日常實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)购城，嘗試用R繪制與Graphpad一樣的線條圖和柱狀圖。 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)：采用RNAi技術(shù)干擾ago1和dcr1兩個(gè)基因虐译，然后熒光定量檢測干擾效果瘪板，計(jì)算出相...
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ArchR官網(wǎng)教程學(xué)習(xí)筆記16（下）:ArchR的軌跡推斷分析系列回顧：ArchR官網(wǎng)教程學(xué)習(xí)筆記1：Getting Started with ArchR[http://www.reibang.com/p/a2bcdfb77961]A...
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如何解決注冊(cè)Google賬號(hào)手機(jī)驗(yàn)證不通過的問題很多人不知道如何用中國手機(jī)號(hào)注冊(cè)谷歌賬號(hào)，注冊(cè)谷歌賬號(hào)手機(jī)號(hào)碼提示不可用漆诽，注冊(cè)谷歌賬戶時(shí)最后一步驗(yàn)證賬戶輸入手機(jī)號(hào)說此電話號(hào)碼無法用于進(jìn)行驗(yàn)證如何解決侮攀？ 輕松三步走注冊(cè)Goo...
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scRNAseq || 堆疊小提琴圖(StackedVlnPlot)的4種實(shí)現(xiàn)方式??最近一直在學(xué)習(xí)單細(xì)胞方面的知識(shí)，無意中看到別人的帖子在分享如何畫堆疊的小提琴圖(StackedVlnPlot)厢拭，順便就學(xué)習(xí)了一下兰英。發(fā)現(xiàn)StackedVlnPlot圖確實(shí)看...
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ChIP-seq數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn)訓(xùn)練（二）
ChIP-seq數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn)訓(xùn)練（二） 四、過濾 raw data -> fastqc 使用trim_galore軟件進(jìn)行質(zhì)控供鸠，過濾 過濾后的文件如下： clean data...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析||Seurat3.1教程:Interoperability between single-cell object formats本節(jié)畦贸，我們演示了在Seurat對(duì)象、singlecellexper對(duì)象和anndata對(duì)象之間進(jìn)行轉(zhuǎn)換的能力楞捂。以建立Seurat與其他單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析工具之間的鏈接薄坏。 Seur...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)筆記-17-用Seurat包分析文章數(shù)據(jù)劉小澤寫于19.8.20-第三單元第十講：使用Seurat包(2、3版本)筆記目的：根據(jù)生信技能樹的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組課程探索smart-seq2技術(shù)相關(guān)的分析技術(shù)課程鏈接在：ht...
