火山圖是測(cè)序分析報(bào)告中最為核心的圖片之一心软。繪制火山圖的方法有許多壕吹，Excel和第三方軟件等著蛙，本文主要運(yùn)用ggplot2和ggrepel兩個(gè)R包演示[1][2]。橫坐標(biāo)為Fol...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：吉林
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R繪圖：ggplot2繪制火山圖 -
Adobe Acrobat Pro DC 2022 軟件下載安裝詳細(xì)教程軟件介紹 Adobe Acrobat Pro DC 2022是一款由Adobe官方推出的PDF編輯和閱讀軟件耳贬，是目前互聯(lián)網(wǎng)上最專業(yè)最優(yōu)秀的桌面pdf解決方案踏堡，它將全球最佳的P...
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PDF文獻(xiàn)文檔引用插入管理學(xué)習(xí)&mendeley不念到大二，很少接觸到PDF文檔咒劲。能讀到博士顷蟆，過手或過眼的有大幾千份。PDF文檔多了腐魂，管理起來很麻煩帐偎。有些文檔從網(wǎng)上下載的時(shí)候，很少能有個(gè)正常的名字挤渔，從新命名并服從管理也是一...
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生信筆記8-基因注釋文件
1肮街、簡(jiǎn)介 注釋文件就是基因組的說明書。告訴我們哪些序列是編碼蛋白的基因判导，哪些是非編碼基因嫉父，外顯子、內(nèi)含子眼刃、UTR等的位置等等绕辖。注釋文件在以下三個(gè)提供參考基因組的網(wǎng)站中都有提供...
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R語言1----桑基（sankey diagram）圖的繪制--sankeyD3在生信分析或者一些其他的數(shù)據(jù)分析中擂红，經(jīng)常會(huì)需要繪制梢羌剩基圖，在這里推薦一個(gè)非常nice的R包-sankeyD3（類似于networkD3昵骤，但是比其功能更加完善）树碱，其出的桑基圖比...
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修改stringtie变秦、ballgown 結(jié)果中部分gene_id為ref_gene_id
問題：stringtie組裝轉(zhuǎn)錄本后會(huì)改變?cè)緟⒖蓟蚪M注釋文件中的gene_id stringtie 組裝成榜、merge的stringtie_merged.gtf注釋文件中的...
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GATK4流程學(xué)習(xí)之RNA-Seq variant calling(SNP+INDEL)GATK4流程學(xué)習(xí)之背景知識(shí)與前期準(zhǔn)備 - 簡(jiǎn)書[http://www.reibang.com/p/97e803755fa6]GATK4流程學(xué)習(xí)之DNA-Seq varia...
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NGS 數(shù)據(jù)過濾之 Trimmomatic 詳細(xì)說明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始數(shù)據(jù)過濾對(duì)后續(xù)分析至關(guān)重要，去除一些無用的序列也可以提高后續(xù)分析的準(zhǔn)確率和效率蹦玫。Trimmomatic 是...
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Hi-C | 基礎(chǔ)介紹一赎婚、技術(shù)原理 基因組研究的維度可以分為很多種，例如下圖所示 其中Hi-C是研究三維結(jié)構(gòu)的一種方法樱溉。Hi-C技術(shù)源于染色體構(gòu)象捕獲（Chromosome Conformatio...
