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celescope使用說(shuō)明
軟件簡(jiǎn)介 Celescope可從二代測(cè)序下機(jī)的原始fastq數(shù)據(jù)開始處理傻工，經(jīng)過(guò)細(xì)胞標(biāo)簽的提取、質(zhì)控與校正孵滞，測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控，參考基因組比對(duì)鸯匹，基因定量坊饶，UMI糾錯(cuò)與計(jì)數(shù)后確定細(xì)胞數(shù)...
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SCENIC
安裝相關(guān)： 在服務(wù)器上安裝SCopeLoomR時(shí)匿级，輸入如下 devtools::install_github("aertslab/SCopeLoomR", build_vig...
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CIBERSORT 免疫浸潤(rùn)(2023.1.2更新版)目前主流的免疫浸潤(rùn)計(jì)算方法是CIBERSORT和ssgsea痘绎，今天介紹CIBERSORT。 1.輸入數(shù)據(jù)要什么 下面這段話摘自CIBERSORT的介紹 Importantly...
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sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程: Integrating datasets to learn cell-type specific responses如果只是做單個(gè)樣本的sc-RNA-seq數(shù)據(jù)分析肖粮，并不能體會(huì)到Seurat的強(qiáng)大孤页，因?yàn)镾eurat天生為整合而生。 本教程展示的是兩個(gè)pbmc數(shù)據(jù)（受刺激組和對(duì)照組）整合分析...
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笨笨的每天都在算法迭代
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從0開始涯雅，包括軟件安裝鲜结，環(huán)境設(shè)置，原始數(shù)據(jù)下載活逆，轉(zhuǎn)換精刷，差異基因分析等整個(gè)流程
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘||Pathway and Network Analysis of Gene List本課件介紹了基于基因集的代謝通路以及網(wǎng)絡(luò)分析，盡管這方面的研究最早不是應(yīng)用在單細(xì)胞層面的划乖，但是在單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘過(guò)程中也可以給我們不少的啟發(fā)贬养。沒(méi)有任何一個(gè)基因是孤島。 在單細(xì)胞...
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周運(yùn)來(lái)仰美，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥儿礼，穩(wěn)健咖杂，瀟灑，大方蚊夫，靠譜诉字。一段生信緣，一棵技能樹知纷。生信技能樹核心成員壤圃，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書創(chuàng)作者琅轧，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家伍绳。
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一個(gè)碼字工
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一切都是最好的安排承璃。
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