博主您好 請問文中參數(shù)的選擇有什么參考文獻嗎?
16s微生物WGCNA實例學(xué)習(xí)筆記WGCNA其譯為加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析钦椭。該分析方法旨在尋找協(xié)同表達的基因模塊(module),并探索基因網(wǎng)絡(luò)與關(guān)注的表型之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系来氧,以及網(wǎng)絡(luò)中的核心基因括尸。適用于復(fù)雜的數(shù)據(jù)...
博主您好 請問文中參數(shù)的選擇有什么參考文獻嗎?
16s微生物WGCNA實例學(xué)習(xí)筆記WGCNA其譯為加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析钦椭。該分析方法旨在尋找協(xié)同表達的基因模塊(module),并探索基因網(wǎng)絡(luò)與關(guān)注的表型之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系来氧,以及網(wǎng)絡(luò)中的核心基因括尸。適用于復(fù)雜的數(shù)據(jù)...
以下只是我自己學(xué)習(xí)LMM所做的筆記巷蚪,并不保證完全正確。 基于R的線性混合效應(yīng)模型(linear mixed effects models)分析 why 為什么要采用線性混合效...
7.網(wǎng)絡(luò)圖 同地圖的空間數(shù)據(jù)一樣淌喻,網(wǎng)絡(luò)圖形在可視化領(lǐng)域占據(jù)了特殊部分,但空間數(shù)據(jù)在投影的使用上與常規(guī)繪圖大不相同雀摘,網(wǎng)絡(luò)圖將其自己的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)以及自己的可視化模式帶入到表格中裸删。由...
"R實戰(zhàn)"專題·第5篇 編輯 | 科白君 本期推送內(nèi)容 學(xué)習(xí)方法一定是在學(xué)習(xí)過程中占最主要的。最近學(xué)了一些新的小技能清蚀,掌握了不少rstudio軟件中高效率的快捷鍵匕荸。我認(rèn)為,這...
主題建模的主要技術(shù)是隱含狄式分布(LDA)枷邪,它假定在文檔里能找到的主題和單詞分布來源于事先按照狄式分布抽樣的隱藏多項分布榛搔。主題建模可以視為聚類的一種形式齿风。 1药薯、數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 bb...
"R實戰(zhàn)"專題·第4篇 編輯 | 科白君 本期推送內(nèi)容 按個人的要求來創(chuàng)建含有研究信息的數(shù)據(jù)集,這是任何數(shù)據(jù)分析的第一步真屯。同時脸候,這也是學(xué)習(xí)R語言過程重要的入門環(huán)節(jié)。特別是初學(xué)...
感謝提醒
R語言實戰(zhàn) | 新手踩過的坑绑蔫,你踩過幾個运沦?(下)"R實戰(zhàn)"專題·第3篇 編輯 | 科白君 本期推送內(nèi)容 緊接著上回講解,與大家分享一下剩余的常見報錯配深。Let’s go~ 想學(xué)習(xí)R語言入門+分析的朋友可以持續(xù)關(guān)注微信公眾號:...
"R實戰(zhàn)"專題·第3篇 編輯 | 科白君 本期推送內(nèi)容 緊接著上回講解左敌,與大家分享一下剩余的常見報錯瘾蛋。Let’s go~ 想學(xué)習(xí)R語言入門+分析的朋友可以持續(xù)關(guān)注微信公眾號:...
在機器學(xué)習(xí)分類任務(wù)中哺哼,常常會碰到樣本不均衡問題,正確處理樣本不均衡會提高模型的實用性和準(zhǔn)確率叼风,本文介紹不均衡問題以及用R語言解決取董。 介紹 樣本不均衡問題是指在機器學(xué)習(xí)分類任務(wù)...
前言 坐標(biāo)軸和圖例被統(tǒng)稱為 guides,通常使用標(biāo)度函數(shù)來控制无宿,如 limits, breaks 和 labels 參數(shù)甲葬。 坐標(biāo)軸與圖例很類似,例如懈贺,坐標(biāo)軸的軸標(biāo)簽與圖例的...
參考:(34-37)https://www.bilibili.com/video/BV19x411X7C6?p=34[https://www.bilibili.com/vid...
1. 你把p3改成
p3<-ggplot()+
geom_rect(aes(xmin=5,xmax=12,ymin=-Inf,ymax=Inf),
fill="grey",alpha=0.3)+
geom_rect(aes(xmin=23,xmax=28,ymin=-Inf,ymax=Inf),
fill="grey",alpha=0.3)+
geom_rect(aes(xmin=35,xmax=52,ymin=-Inf,ymax=Inf),
fill="grey",alpha=0.3)+
geom_rect(aes(xmin=55,xmax=59,ymin=-Inf,ymax=Inf),
fill="grey",alpha=0.3)+
geom_line(df3,mapping = aes(x=x,y=y), size=1,color="#6994f3")
就能解決
2. 這個報錯是因為annotation不支持expression经窖。圖沒啥問題就別管了……
3. 最近在不同平臺上發(fā)現(xiàn)這個問題,我的結(jié)論是macos下自帶抗鋸齒梭灿,win10下就沒有……
最近在看論文 Phased diploid genome assemblies and pan-genomes provide insights into the genet...
R語言是單核計算語言,在數(shù)據(jù)建谋ざ剩或計算過程中配乱,常常出現(xiàn)相同或相似任務(wù)的重復(fù)計算,一般操作是for循環(huán)處理或采用apply族函數(shù)處理皮迟,為了更快完成計算搬泥,采用并行計算是更優(yōu)的選擇...