scRNA-seq數(shù)據(jù)分析想必大家都比較熟悉了，自2014年nature biotechnology提出單細胞擬時分析或稱為軌跡分析（Trajectory）已經(jīng)有五個年頭了纽谒。...
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STREAM:一款scRNA-seq擬時分析工具 -
您好遂唧，有成像質(zhì)譜流式數(shù)據(jù)相關(guān)的分析方法和例子數(shù)據(jù)么
成像質(zhì)譜流式原理簡介---Imaging Mass Cytometry
成像質(zhì)譜流式技術(shù) 一般的流式細胞儀是用于細胞懸浮液的分析，但對于固態(tài)的組織切片則無能為力之拨。IMC結(jié)合了激光消融（Laser ablation）茉继，可以將經(jīng)過帶有同位素的抗體或者...
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非root用戶不能sudo怎么辦呢
NotWritableError: The current user does not have write permissions to a required path.
修改權(quán)限，可能是之前用sudo conda造成的
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scmap:單細胞RNA-seq數(shù)據(jù)跨數(shù)據(jù)集的投影隨著越來越多的scRNA-seq數(shù)據(jù)集可用蚀乔，對它們進行比較是關(guān)鍵馒疹。主要的應(yīng)用程序是比較不同實驗室收集的具有相似生物學來源的數(shù)據(jù)集，以確保注釋和分析是一致的乙墙。此外颖变，隨著大量的參...
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sc-Review：單細胞RNA-seq數(shù)據(jù)分析最佳實踐Luecken MD, Theis FJ. Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutoria...
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實驗記錄10: 用Monocle進行偽時間分析概要 本文主要討論Seurat對象導入到Monocle中直接進行分析的可行性腥刹，分兩種情況：①經(jīng)過數(shù)據(jù)清洗、標準化和聚類的Seurat對象導入②未經(jīng)過任何處理的Seurat對象...
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SeuratData||你需要的單細胞數(shù)據(jù)分析實例數(shù)據(jù)合集
SeuratData是一種使用R的內(nèi)部包和數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)以Seurat對象的形式分發(fā)數(shù)據(jù)集的機制汉买。它代表了一種方便用戶訪問Seurat中使用的數(shù)據(jù)集的方法衔峰。 我們創(chuàng)建了seur...
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10X單細胞測序分析軟件:Cell ranger單細胞測序有著漫長的過去，卻只有短暫的歷史---誰說的！ 說她漫長是因為到如今也有十幾年的歷史了垫卤，說她段短暫是因為針對單細胞的分析工具越來越有意義開發(fā)周期卻越來越短威彰。一般生物...
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如果你是程序員，或者有一顆喜歡寫程序的心慨代，喜歡分享技術(shù)干貨邢笙、項目經(jīng)驗、程序員日常囧事等等侍匙，歡迎投稿《程序員》專題氮惯。 專題主編：小彤花園 http://www.reibang.com/users/4a4eb4feee62/ 【程序員】專題拒稿指北：http://www.reibang.com/p/7c8b33b5f63b 投稿須知： 1.收錄相關(guān)技術(shù)文章，但不限于技術(shù)想暗，也可以是項目經(jīng)驗類的文章和程序員日常妇汗。 2.文章內(nèi)不得有任何推廣信息。包括但不限于公眾號江滨、微博铛纬、微信，更不得在通過投稿后再修改文章加入推廣信息唬滑。你可以將這些推廣以及個人信息放在個人主頁介紹里告唆。 3.字數(shù)極少，段落混亂晶密，大段代碼沒有放到代碼框的文章不收錄 4.不相關(guān)的內(nèi)容不收錄擒悬，請確認文章內(nèi)容和本專題相關(guān) 目前針對優(yōu)質(zhì)作者及愛好者，開設(shè)了官方程序員微信群稻艰，希望加入請發(fā)簡信給主編小彤花園索取個人微信懂牧，主編會將你加入到【程序員】微信群，分享內(nèi)容尊勿，收獲知識僧凤。添加微信時備注昵稱。
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課程會在2019年9月底之前錄制完畢并上線： 課程說明在：https://mp.weixin.qq.com/s/AV2uTbsvJGBRq_zv7yDmNg 所有代碼在：https://github.com/jmzeng1314/scRNA_smart_seq2 觀看鏈接 手機微信觀看（推薦）：http://jm.grazy.cn/wechat/course/detail?cid=53 電腦瀏覽器的鏈接 http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html?cid=53
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2019-07-20
原文地址：https://mp.weixin.qq.com/s/xg7cggq45tBI0EQUSxPKFw 8.1 Introduction 第八章講的是ggplot2的主...
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