1. 孟德爾隨機化方法 傳統(tǒng)觀察性流行病學(xué)研究在發(fā)現(xiàn)疾病病因以及因果推斷中存在諸多挑戰(zhàn)枝哄，比如反向因果關(guān)聯(lián)棉圈、潛在混雜因素、微效暴露因素以及多重檢驗等诺苹，當(dāng)研究者訴諸于隨機對照試驗...
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孟德爾隨機化推斷暴露因素與健康結(jié)局的因果關(guān)系 -
文獻學(xué)習(xí)096--Dynamics of Cardiac Neutrophil Diversity in Murine Myocardial Infarction1. Time-Dependent Transcriptional Heterogeneity of Neutrophils in the Infarcted Heart 作...
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文獻學(xué)習(xí)084--組織原位CCR2+巨噬細胞通過TLR9/MyD88/CXCL5 signaling促進neutrophil extravasation為了探究心肌缺血灌注損傷時調(diào)控中性粒細胞trafficking的upstream signals，作者使用了小鼠心臟移植模型（An essential advantage o...
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文獻學(xué)習(xí)088--組織原位巨噬細胞通過SR A1-c Myc軸減輕阿霉素誘導(dǎo)的心肌病通訊作者： 1. Both Monocyte-Derived and Resident Macrophages Participate in DiCM Development...
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我是外科醫(yī)生玲躯，所以很粗暴的喲！～～<br>歡迎大家關(guān)注微博“醫(yī)學(xué)小蛋散”哦～<br>讓學(xué)醫(yī)快樂～ <br>記錄行醫(yī)之旅～
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計算特定細胞群對疾病狀態(tài)的貢獻度在單細胞測序揭示心梗后的心臟免疫動態(tài)變化[http://www.reibang.com/p/c5043790077a]中，作者對MI不同時間點的小鼠心臟組織進行了單細胞測序...
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髓系細胞工具鼠匯總
一跷车、巨噬細胞 1. Cre工具鼠 Cre工具鼠是通過在小鼠marker基因位點敲入Cre/CreERT2或者Dre/DreERT2元件構(gòu)建而成棘利。Cre工具鼠跟特定的flox小...
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CyTOF分析流程（一）：基于R語言的CyTOF數(shù)據(jù)預(yù)處理小魚爸 2023-08-03 簡介 質(zhì)譜流式(Mass cytometry，CyTOF)得到越來越多的應(yīng)用朽缴，適合用于深入表征健康和疾病組織異質(zhì)性善玫。目前，原始文件的預(yù)處理通常是...
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當(dāng)紅辣子雞-空間轉(zhuǎn)錄組與單細胞轉(zhuǎn)錄組的整合分析（下篇）
作者：堯小飛審稿：童蒙編輯：amethyst SPOTlight SPOTlight 的目標是提供一種工具密强，能夠?qū)Π毎旌衔锏拿總€捕獲位置中存在的細胞類型和細胞類型比例進...
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logfc有區(qū)別茅郎，presto算的幾何平均值，findallmarkers計算的算數(shù)平均值
單細胞之富集分析-1：單細胞GSEA分析流程
單細胞GSEA分析需要的文件有兩個：1. 單細胞基因表達變化數(shù)據(jù)（兩列或渤，一列是geneid/gene symbol系冗，一列是logFC）（文件格式：.rnk）2. 目標基因集（...
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T細胞接受抗原刺激后的五個階段及其表型看到簡書上 小牛學(xué)生信 老師的筆記，也來源于流式中文網(wǎng)劳坑，很不錯毕谴，mark一下 2022-11-08 T細胞表征 - 簡書[https://www2.jianshu.com/p...
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文獻學(xué)習(xí)074--[sc]T cells specific for α-myosin drive immunotherapy-related myocarditis在此前的研究中成畦，作者報道了一個ICI-MC小鼠模型距芬，在這篇文章里，作者用的也是這個模型循帐。 1. Cardiac clonal CD8+ T cells are abundan...
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文獻學(xué)習(xí)094--自我更新的心臟組織原位巨噬細胞限制心梗后的adverse remodeling1. Single-cell analyses show unique cardiac macrophage subsets. Fig 1a： 對心臟CD45+CD64+CD...
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文獻學(xué)習(xí)095--心臟原位巨噬細胞來源的Legumain通過促進心肌梗死后凋亡心肌細胞的清除和降解來改善心臟修復(fù)1. Lgmn Expression Increases After MI in Mice 為了確定參與endocytosis 和 intracellular traffic...
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不看私信<br>看不到的文章是被簡書鎖了
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文章復(fù)現(xiàn) | WGCNA算法識別腎透明細胞癌CD8T細胞浸潤相關(guān)關(guān)鍵基因前言：加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析（weighted gene co-expression network analysis拄养，WGCNA）是研究相似基因表達模式的一種方法离斩，通過尋找...
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TIMER20和cibersort一個既能分析測序數(shù)據(jù)（最好是TPM格式），又能分析芯片數(shù)據(jù)的網(wǎng)站細胞免疫浸潤網(wǎng)站使用 1.cibersort 數(shù)據(jù)輸入格式：輸入數(shù)據(jù)的要求： 1.不可以有負值和缺失值 2.不要取log 3.如果是芯片數(shù)據(jù)瘪匿，昂飛芯片使用RMA標準化跛梗，Ill...
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學(xué)習(xí)小組Day2筆記--知未1.什么是linux，什么是服務(wù)器棋弥？ ??linux是個操作系統(tǒng)核偿，它開源、免費顽染、穩(wěn)定漾岳、安全...優(yōu)點多多~ 主要作為服務(wù)器使用，支持多用戶同時使用且相互獨立粉寞，文件系統(tǒng)為樹狀結(jié)...
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