網(wǎng)上有一些很詳細(xì)的教程分蓖，我這里只記錄要點潭兽，其余部分按以下教程步驟來就行。 1. PicGo安裝 國內(nèi)下載可能較慢，取決于你的網(wǎng)速片橡。下載安裝好后，需要安裝nodejs[http...
發(fā)簡信
IP屬地：北京
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PicGo + Gitee +Typora實現(xiàn)markdown圖床 -
蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測、結(jié)果解讀與評分蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測听哭，只要有目的基因的氨基酸序列就可以做，不限物種塘雳，沒有太多要求陆盘，可為文章增色。windows版本的VMD軟件可在公眾號生信星球回復(fù)“VMD”獲得败明，且附帶軟件中...
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努力努力再努力~<br>個人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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群落堆疊柱狀圖+沖擊圖繪制群落堆疊柱狀圖示例文件1.某一分類級別豐度文件： 2.分組文件： OK妻顶，接下來開始繪制： 1.準(zhǔn)備一下顏色信息 因為屬或種水平物種比較多酸员，可以多準(zhǔn)備一些 準(zhǔn)備作圖文件 普通柱...
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利用PfamScan尋找同源基因家族
Pfam是一個蛋白家族數(shù)據(jù)庫，其中Pfam-A是手工確定的高質(zhì)量的蛋白家族讳嘱，Pfam-B是自動注釋的幔嗦，是對A的補充。目前已更新到32.0沥潭，下載地址為ftp://ftp.ebi...
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謝謝分享邀泉。免費版有流量限制嗎
內(nèi)網(wǎng)穿透，將內(nèi)網(wǎng)地址映射為外網(wǎng)地址
最近由于項目需要钝鸽，測試微信支付回調(diào)汇恤，但是微信回調(diào)只能訪問到外網(wǎng)地址，自己電腦上的內(nèi)網(wǎng)地址訪問不到拔恰，所以需要將內(nèi)網(wǎng)地址映射為外網(wǎng)地址因谎，這樣外網(wǎng)就能訪問我的內(nèi)網(wǎng)項目了。 在網(wǎng)上找...
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eggNOG 對基因組進(jìn)行GO注釋
簡要介紹利用eggNOG進(jìn)行在線注釋GO 其原理將query序列與eggNOG編號的蛋白進(jìn)行多序列比對患朱，確定保守位點，分析其進(jìn)化關(guān)系炊苫。 每個eggNOG編號的蛋白為一類蛋白裁厅。...
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正需要這個冰沙，找保守序列感覺好難。蛋白的氨基酸序列跟二級結(jié)構(gòu)不知道有沒有對應(yīng)關(guān)系
通過多序列比對找到保守區(qū)域
序列標(biāo)識圖 sequencelogo 工具使用 使用在線的工具执虹，WebLogo3 字母大小都是根據(jù)上方的運算求得的拓挥，通常來說出現(xiàn)次數(shù)多的字母，體積也就越大袋励，而如果某一列只有一...
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通過多序列比對找到保守區(qū)域序列標(biāo)識圖 sequencelogo 工具使用 使用在線的工具侥啤，WebLogo3 字母大小都是根據(jù)上方的運算求得的，通常來說出現(xiàn)次數(shù)多的字母茬故，體積也就越大盖灸，而如果某一列只有一...
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全自動分析工具 | 原核生物（基因家族）蛋白功能及進(jìn)化分析寫在前面 Emmm，無意間看到的一個工具磺芭。從某種意義上來說赁炎，類似真核生物中的基因家族分析自動化工具。當(dāng)然钾腺，差別還是有不少的徙垫。雖然我?guī)缀醪蛔鲈松锵嚓P(guān)課題，不過這個工具相信對...
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Curtis Huttenhower：進(jìn)化樹分析發(fā)現(xiàn)新型R.gnavus進(jìn)化支富集于IBD患者腸道內(nèi)導(dǎo)讀 IBD（炎癥性腸部迓）是一種慢性胃腸道炎癥松邪，該疾病可能是宿主對腸道微生物的免疫應(yīng)答導(dǎo)致的。IBD和活性氧和活性氮的產(chǎn)生增加有關(guān)系哨查。而活性氧和活性氮能引起宿主細(xì)胞和腸道微生...
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加油，期待完整版
基因功能注釋
1.InterPro注釋 InterPro數(shù)據(jù)庫簡介 Interpro是EBI開發(fā)的一個整合的蛋白家族功能注釋數(shù)據(jù)庫剧辐，包括Gene3D寒亥、CDD、Pfam等10幾個數(shù)據(jù)庫荧关，官網(wǎng)...
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一行命令完成RNAseq差異分析+火山圖+散點圖今天來給大家分享的是：怎么一行命令完成RNAseq數(shù)據(jù)差異分析+火山圖+散點圖溉奕。 一、準(zhǔn)備3個文件： 1忍啤、基因表達(dá)count文件：gene_count_edger.txt 格...
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無監(jiān)督一致性聚類Consensus Clustering(一致性聚類)加勤，無監(jiān)督聚類方法，可根據(jù)不同組學(xué)數(shù)據(jù)集將樣本區(qū)分成幾個亞型同波，從而發(fā)現(xiàn)新的疾病亞型或者對不同亞型進(jìn)行比較分析鳄梅。 Conse...
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拿到基因表達(dá)矩陣之后的那點事(四)得到了差異基因并進(jìn)行了一頓操作可視化后，我們可以開始富集分析了未檩，Don't say so much戴尸，要富集當(dāng)然首推Y叔的成功之作-- Clusterprofiler, 因為我...
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可以從fasta中提取基因序列的4款軟件
前言 ??做生分析有時候需要從基因組fasta文件中提取基因的序列，對于這個需求有不少現(xiàn)成的軟件可以來實現(xiàn)冤狡，今天來跟大家分享4款可以完成這個需求的軟件孙蒙，廢話不多說了项棠，直接來看...
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@Peng_001 謝謝。剛剛接觸16S擴(kuò)增子分析挎峦。對全基因組的分析還不太懂香追。
全基因組分析實踐（參考：堿基礦工）
參考：堿基礦工從零開始完整學(xué)習(xí)全基因組測序數(shù)據(jù)分析：第4節(jié) 構(gòu)建WGS主流程GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實踐（上） 前言 由于人類基因組數(shù)據(jù)過大（我的小小服務(wù)器也只有50...
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