信你個(gè)鬼

使用這個(gè)軟件的原因主要在于前面使用MACS2進(jìn)行m6A peak calling猜谚，下游沒有可用的現(xiàn)成的方法銜接此部分結(jié)果進(jìn)行差異peak分析，可能得自己根據(jù)文獻(xiàn)想辦法使用什么...

生信start_site

前面的學(xué)習(xí)筆記里赌渣，對(duì)于scATAC-seq的分析魏铅，使用的是signac R包進(jìn)行的。前幾天在一次偶然的機(jī)會(huì)里坚芜，有幸和一個(gè)專門做生信的老外聊了聊（紐約某校的PI）览芳，從他那里聽說...

信你個(gè)鬼

數(shù)據(jù)預(yù)處理之后是rRNA去除，這一步驟是可選步驟鸿竖。 使用Hisat2去除數(shù)據(jù)中的rRNA的原代碼沧竟，摳出來看看： 一、rRNA序列下載 在之前的教程中缚忧，我使用的NCBI的rRN...

Z_bioinfo

1.進(jìn)入U(xiǎn)CSC官網(wǎng)（ 2.進(jìn)入table browser工具后進(jìn)行選擇： track里可以選擇NCBI RefSeq或者UCSC gene悟泵，這里選了NCBI group一般...

一只小腦斧

m6A圖文復(fù)現(xiàn)03-測(cè)序數(shù)據(jù)去除rRNA序列并且比對(duì)到參考基因組 - 云+社區(qū) - 騰訊云 (tencent.com)[https://cloud.tencent.com/d...

Seurat_Satija

cellranger是10X GENOMICS單細(xì)胞上游分析的軟件禁筏，主要有4個(gè)流程 mkfastq、定量 count鞠呈、組合 aggr、reanalyze右钾。如果是bcl原始測(cè)序...

KS科研分享與服務(wù)

久等了蚁吝，接上一次內(nèi)容。這次我們要讓熱圖更加復(fù)雜化舀射。 實(shí)際上窘茁，有些情況下做熱圖可能只需要標(biāo)注對(duì)照組、實(shí)驗(yàn)組即可脆烟。但是大多時(shí)候山林，可以在熱圖上體現(xiàn)更多信息，比如邢羔，除了分組驼抹，還有不同...

云養(yǎng)江停

單細(xì)胞分析流程之Cell Ranger 相信做單細(xì)胞的小伙伴對(duì)Cell Ranger這個(gè)軟件都不陌生，我們今天就來了解一下Cell Ranger的安裝和使用方法拜鹤。Cell R...