TCGA數(shù)據(jù)庫中含有的癌癥名稱,簡寫和中文名稱 Abbr英文名稱中文名稱ACCAdrenocortical carcinoma腎上腺皮質(zhì)癌BLCABladder Urothe...

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簡介 CIBERSORT這款軟件利用反卷積的方法非剃,利用單細(xì)胞RNA-seq的數(shù)據(jù)慈参,提取特征后,反推Bulk-seq各類細(xì)胞成分所占比例涩蜘。這款軟件目前推出了CIBERSORTx...
今天我們測試一下軟件scVelo嚼贡,這個軟件應(yīng)該很多人都用過了,但是玩的好的人同诫,應(yīng)該沒幾個粤策。 加載 讀取數(shù)據(jù)(loom, h5ad, csv), 我的數(shù)據(jù)是根據(jù)velocyto...
正常來講,看懂以下圖片误窖,就已經(jīng)可以明了關(guān)于miRNA命名的大部分問題了叮盘。 (圖片來源于網(wǎng)絡(luò),鏈接已迷失~~~) 以下內(nèi)容選自miRBase命名法說明霹俺,翻譯不當(dāng)柔吼,敬請諒解。 W...
忽略矩形中的蛋白顏色丙唧,但不要忽略箭頭的顏色 均手工繪制愈魏,通過查閱文獻(xiàn)還有KEGG綜合所畫,錯誤在所難免想际∨嗦可留言。參考文獻(xiàn)眾多胡本,不再一一列出牌柄。 ----------------...
基因組組裝 1.k-mer 那么我們首先要看一下k-mer是什么。它的定義是:是指將一條序列分成包含k個堿基的子字符串侧甫,如果reads長度為L珊佣,k-mer長度設(shè)為k傻昙,則產(chǎn)生的...
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