什么是tibble 簡而言之tibble是data.frame的一種形式，語法和data.frame較為相似，其實(shí)大部分功能都與data.frame相似仆葡。tibble來自于t...
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R tibble簡介 -
R語言pheatmap熱圖色條控制小技巧本期介紹一個(gè)控制熱圖顏色范圍并規(guī)定指定值顏色的小技巧亿胸。 使用的是R語言的pheatmap包伴澄，先生成隨機(jī)數(shù)據(jù)： data1如下： 查看數(shù)據(jù)范圍： 使用上面的矩陣做熱圖真仲，要求低值...
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[解決]Origin繪圖 y 軸不按順序排列問題前言 首先這里的Origin是不是EA公司游戲發(fā)布平臺哈喇颁。Origin是由OriginLab公司開發(fā)的一個(gè)科學(xué)繪圖漏健、數(shù)據(jù)分析軟件，支持各種各樣的2D/3D圖形橘霎。這個(gè)款軟件上手...
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Exome-seq蔫浆、ChIP-seq、RNA-seq之間的差異
本文轉(zhuǎn)自沈夢圓的博客 全外顯子測序是啥姐叁？轉(zhuǎn)錄組測序是啥克懊？轉(zhuǎn)錄組測序又是啥？他們之間有什么差別么七蜘？傻傻分不清谭溉，不用怕，多學(xué)習(xí)下就會了橡卤，下面讓我們一起來看看扮念！ 1 溫基礎(chǔ)測序深度...
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VMware 虛擬機(jī)無法連接網(wǎng)絡(luò)解決辦法VMware中創(chuàng)建的虛擬機(jī)無法連接網(wǎng)絡(luò)時(shí)，解決方案如下： 1.首先確保自己的物理機(jī)的網(wǎng)絡(luò)是連通的碧库，在這里不多做介紹柜与。 2. 點(diǎn)擊VMware[https://so.csdn....
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ggplot2分面作圖然后在其中一個(gè)添加注釋ggplot2分面作圖如果添加注釋通常在每一個(gè)小圖都會添加上比如 如果我只想在第一個(gè)小圖添加一個(gè)注釋該如何實(shí)現(xiàn)呢？經(jīng)過搜索找到的辦法基本都是為添加注釋重新準(zhǔn)備單獨(dú)的一份數(shù)據(jù) ...
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個(gè)人向ggplot2箱線圖總結(jié)主要從如何看圖嵌灰、用圖與作圖三個(gè)方面來對箱線圖進(jìn)行理解和總結(jié)弄匕。 1、看圖 如圖所示沽瞭，箱線圖是將一組數(shù)據(jù)按照大小順序排列后進(jìn)行繪制的迁匠，包含6個(gè)數(shù)據(jù)節(jié)點(diǎn)，分別表示出數(shù)據(jù)的上邊緣驹溃、上...
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SCAN | 查看基因的eQTL及SNP是哪些基因的eQTL簡介 該數(shù)據(jù)庫包含針對SNP（人類）的兩類注釋內(nèi)容： 基于位置關(guān)系城丧，給出該SNP位于基因哪個(gè)區(qū)域（如intronic, intergeni, etc）。如果該SNP與某基因的...
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R語言-相乘&相加交互作用計(jì)算的兩種方法方法一 基于R包epiR: Tools for the Analysis of Epidemiological Datahttps://cran.r-project.org/...
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z-score公式錯(cuò)了哦：
z-score=(up-down)/sqrt(count)富集分析圈圈圖
0.需求解讀 這是富集分析比較常見的一個(gè)圖布疙，左圖右表蚊惯。 圖的最外層是GOterm的編號愿卸，中間灰色背景層表示基因的logFC分布，可以看到每個(gè)term對應(yīng)到的市上調(diào)基因還是下調(diào)...
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將AI中的對象復(fù)制到ppt編輯
選中AI中的對象 ctrl+C復(fù)制 打開ppt ctrl+alt+V選擇 “圖片（增強(qiáng)型圖元文件）“ 粘貼（目前嘗試發(fā)現(xiàn)需要用office截型，WPS不行） 在ppt中選中粘貼的...
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怎樣在imageJ中扣除/添加部分選擇區(qū)域
扣除區(qū)域： 用方框擦酌、圓形、自由選擇或者魔棒選擇目標(biāo)區(qū)域（tips:魔棒工具圖標(biāo)雙擊可以調(diào)整選擇閾值） 按ctrl+T菠劝，或者點(diǎn)擊edit-selection-add to ma...
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Logistic回歸分析時(shí)幾個(gè)需要注意的問題
1、關(guān)于樣本含量的問題 logistic回歸分析中睁搭，到底樣本量多大才算夠赶诊，這一直是個(gè)令許多人困惑的問題。盡管有的人從理論角度提出了logistic回歸分析中的樣本含量估計(jì)园骆，但...
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使用clusterProfiler進(jìn)行富集分析clusterProfiler是業(yè)界大神Y叔寫的R包舔痪，看過了它的繪圖就會使人沉迷于其顏值無法自拔。本文很多內(nèi)容直接翻譯自官方文檔锌唾，加上了我的測試數(shù)據(jù)（還是以果蠅為例）锄码。 一、...
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ComplexHeatmap繪制復(fù)雜熱圖pheatmap交互 最近ComplexHeatmap更新可以將pheatmap對象進(jìn)行參數(shù)轉(zhuǎn)換晌涕。新增的ComplexHeatmap::pheatmap()的功能與pheat...
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統(tǒng)計(jì)學(xué)4-辛普森悖論對撞因子 對撞因子（Collider）【1】滋捶，在統(tǒng)計(jì)學(xué)和圖模式中，是指同時(shí)被兩個(gè)以上的變量影響的變量余黎，而這些影響對撞因子的變量之間不一定有因果關(guān)系重窟。因?yàn)樵诃h(huán)路圖上會顯示為有兩...
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【R語言小技巧】怎樣創(chuàng)建行數(shù)為0的數(shù)據(jù)框
1.用data.frame() 2.先創(chuàng)建矩陣，再轉(zhuǎn)換為數(shù)據(jù)框 該方法的優(yōu)勢是惧财，當(dāng)列數(shù)很多的時(shí)候創(chuàng)建比較方便
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GO和Pathway富集分析的背景基因集
功能(GO)或者通路(Pathway)富集分析時(shí)巡扇，都會涉及到 Background; 做分析時(shí)，分析工具會提供一些數(shù)據(jù)供使用者選擇或者使用自定義的gene list垮衷。 例如厅翔，...
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【轉(zhuǎn)錄組學(xué)】featureCounts軟件中的length是怎樣計(jì)算的？
分析過程 以rela基因?yàn)槔笸唬琭eatureCounts結(jié)果文件“all.id.txt”中提供的信息為： 接下來用R語言進(jìn)行分析:1. 提取featureCounts結(jié)果中的...