發(fā)簡信
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解決報(bào)錯(cuò)ImportError: cannot import name 'GC' from 'Bio.SeqUtils'
簡單記錄.在安裝軟件的時(shí)候遇到ImportError呼巴，模塊找不到.在我的情況中是因?yàn)閎iopython的版本問題. 所以座硕，降低biopython...
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<轉(zhuǎn)發(fā)>如何高效回復(fù)審稿人意見（附實(shí)例）來自---如何高效回復(fù)審稿人意見（附實(shí)例） - 來研的文章 - 知乎https://zhuanlan.zhihu.com/p/491096355...
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Fit-hic 2 通過hic數(shù)據(jù)檢測顯著性互作安裝官網(wǎng)中提到三種安裝方法，可通過conda, pip皮获，git clone 安裝該軟件.我們這里利用conda,非常簡單快速.1.1 conda...
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[報(bào)錯(cuò)記錄]:deeptools報(bào)錯(cuò)AttributeError: module 'numpy' has no attribute 'float'.
完整報(bào)錯(cuò)信息 在我的情況中，降低numpy版本就能解決 降低為numpy==1.18.3
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3D genome builder--根據(jù)hic數(shù)據(jù)和ChIP數(shù)據(jù)預(yù)測基因組3D模型一開始覺得用hic數(shù)據(jù)預(yù)測基因組3D結(jié)構(gòu)還是挺有趣的蝴乔，但是用了幾個(gè)軟件反反復(fù)復(fù)折騰效果并不好挣棕，快失去耐心了。偶然間看見一篇新的文獻(xiàn)固惯，覺得正是我所...
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TEtranscripts--計(jì)算轉(zhuǎn)座子(TEs)在RNA-seq中的定量和差異表達(dá)
寫在前面梆造，最近為了解決這個(gè)問題，看了很多軟件，要么是單細(xì)胞技術(shù)镇辉，要么是物種限制屡穗，總之花了挺多時(shí)間。本來打算使用SQuIRE忽肛，但是卡在了BUILD...
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FastQ_Screen 檢測原始數(shù)據(jù)fastq污染情況下載該軟件需要以下依賴 [Bowtie], [Bowtie2] 或者 [BWA]. Perl*[Bismark](可選項(xiàng)村砂， 針對bisulfit...
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DNA replication stress --DNA 復(fù)制壓力DNA復(fù)制壓力是指某些細(xì)胞的DNA在復(fù)制過程中，他們的基因組受到各種壓力屹逛，導(dǎo)致復(fù)制叉停滯的現(xiàn)象础废。 有許多原因會導(dǎo)致復(fù)制壓力，其中有: 1.核糖核...
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FAN-C--基于python的分析和可視化HiC數(shù)據(jù)的工具包
下載1.1 創(chuàng)建新環(huán)境 1.2 pip 下載 note罕模，如果出現(xiàn)報(bào)錯(cuò)可以嘗試以下辦法 2.測試2.1 下載測試數(shù)據(jù) 2.2 測試軟件 --run...