tags: RCategories: 遺傳參數(shù) ···param= function(){ GA=as.matrix(read.table("GA.csv",h=F,sep=...
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再次體驗一下TBtools的強大。使用TBtools對基因家族進行分析资厉,進化樹、Motifs 蔬顾、結構域和基因結構多圖合一宴偿。 一湘捎、數(shù)據(jù)準備 1.基因組組裝結果fasta格式 2...
在進行序列分析時,難免要做一張序列兩兩比較的同一性(大致和相似性差不多)表窄刘,比如下面這樣的: 單一核苷酸或者氨基酸序列同一性表比較好辦窥妇,可以通過Geneious (付費軟件)...
本期的主題仍然屬于《單個基因的生物信息學分析》,主要講解介紹一下單個蛋白質(zhì)結構域分析娩践。 網(wǎng)站鏈接如下:InterPro 打開主頁面顯示如圖1活翩,注意的是,一次只能進行一個蛋白序...
1. 軟件簡介 CFVisual_V2.1軟件是一款借助Python語言的matplotlib庫和PySide2庫進行生物序列結構繪圖的數(shù)據(jù)可視化軟件欺矫,主要用于生物信...
寫在前面 做基因功能的人都會特別注意基因上有什么功能結構域纱新,通常我們認為,結構域決定了這個基因的功能穆趴。隨著高通量測序技術的發(fā)展脸爱,我們完全可以通過一級序列來預測該基因的結構域,...
?一般多序列比對的結果都需要進行編輯再進行下一步分析簿废。 這個推送中用于舉例操作的比對結果可以在網(wǎng)站下載: http://www.tcoffee.org/dummy_aln.h...
#什么是蛋白質(zhì)二級結構? 按照結構層次劃分络它,蛋白質(zhì)結構可以分為一級結構族檬、二級結構、三級結構化戳、四級結構: 蛋白質(zhì)二級結構(secondary structure of prot...