tags: RCategories: 遺傳參數(shù) ···param= function(){ GA=as.matrix(read.table("GA.csv",h=F,sep=...
發(fā)簡信
IP屬地：江蘇
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計(jì)算重復(fù)力模型結(jié)果的遺傳力及相關(guān)R代碼
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遺傳力再解讀發(fā)現(xiàn)對三大遺傳參數(shù)的來源和用途還是不清楚躲履，今天特意來看了下遺傳力的介紹见间，大概了解了 一般我們只討論狹義遺傳力 這圖十分關(guān)鍵，解決我多年的難題工猜，根據(jù)通徑計(jì)算得到遺傳力的計(jì)算公式...
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TBtools | 基因家族分析 (進(jìn)化樹米诉、Motifs、結(jié)構(gòu)域)再次體驗(yàn)一下TBtools的強(qiáng)大篷帅。使用TBtools對基因家族進(jìn)行分析史侣，進(jìn)化樹、Motifs 魏身、結(jié)構(gòu)域和基因結(jié)構(gòu)多圖合一惊橱。 一、數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 1.基因組組裝結(jié)果fasta格式 2...
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使用BioAider快速生成核苷酸+氨基酸序列同一性矩陣在進(jìn)行序列分析時箭昵，難免要做一張序列兩兩比較的同一性（大致和相似性差不多）表税朴，比如下面這樣的： 單一核苷酸或者氨基酸序列同一性表比較好辦，可以通過Geneious （付費(fèi)軟件）...
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中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 生物學(xué)博士在讀
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單個基因的生物信息學(xué)分析(2)-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預(yù)測本期的主題仍然屬于《單個基因的生物信息學(xué)分析》，主要講解介紹一下單個蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域分析颤殴。 網(wǎng)站鏈接如下：InterPro 打開主頁面顯示如圖1觅廓，注意的是，一次只能進(jìn)行一個蛋白序...
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CFVisual繪制Motif+基因結(jié)構(gòu)+結(jié)構(gòu)域+進(jìn)化樹+啟動子圖的單獨(dú)或組合圖1. 軟件簡介 CFVisual_V2.1軟件是一款借助Python語言的matplotlib庫和PySide2庫進(jìn)行生物序列結(jié)構(gòu)繪圖的數(shù)據(jù)可視化軟件涵但，主要用于生物信...
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【HMMSCAN】使用pfam數(shù)據(jù)庫對多序列文件進(jìn)行結(jié)構(gòu)域注釋
寫在前面 做基因功能的人都會特別注意基因上有什么功能結(jié)構(gòu)域杈绸，通常我們認(rèn)為，結(jié)構(gòu)域決定了這個基因的功能矮瘟。隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展蝇棉，我們完全可以通過一級序列來預(yù)測該基因的結(jié)構(gòu)域，...
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微信公眾號番茄隨筆
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【陪你學(xué)·生信】十板辽、編輯對多序列比對結(jié)果
?一般多序列比對的結(jié)果都需要進(jìn)行編輯再進(jìn)行下一步分析奇瘦。 這個推送中用于舉例操作的比對結(jié)果可以在網(wǎng)站下載： http://www.tcoffee.org/dummy_aln.h...
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蛋白質(zhì)序列比對與蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測#什么是蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)耳标？ 按照結(jié)構(gòu)層次劃分，蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)可以分為一級結(jié)構(gòu)邑跪、二級結(jié)構(gòu)次坡、三級結(jié)構(gòu)、四級結(jié)構(gòu)： 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)（secondary structure of prot...
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生信小白如何繪制蛋白序列的二級結(jié)構(gòu)可視化圖大家經(jīng)常在文獻(xiàn)中看到非常漂亮的多序列比對圖，上面標(biāo)注了各種蛋白二級結(jié)構(gòu)的信息轴踱，現(xiàn)在小白將目前見過的最好看的序列比對圖和蛋白二級結(jié)構(gòu)的組合圖的作圖方法作分享症脂，希望對大家的科研工...
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polyA 信號
定義聚腺苷酸化信號 (PAS，Polyadenylation [poly(A)] signals) 是真核蛋白質(zhì)編碼基因的定義特征淫僻。核心序列基序 AAUAAA诱篷，隨后證明需要側(cè)...
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gggenes基因結(jié)構(gòu)圖繪制請教一下gggenes在繪制結(jié)構(gòu)圖時調(diào)整哪個參數(shù)會一次畫幾十條棕所，現(xiàn)在畫出來的都是這樣的
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2022-04-27使用 GSDS 繪制基因結(jié)構(gòu)圖GSDS[http://gsds.cbi.pku.edu.cn/] 是由北京大學(xué)生物信息學(xué)中心提供的用于顯示基因外顯子橙凳、內(nèi)含子、保守元件的組成和位置的一個在線服務(wù)笑撞，全英文界面...
