作為表格文本處理命令awk的延伸，Heng Li開發(fā)了專門處理生物信息學(xué)的文件（例如bed, sam, vcf, gtf等）的命令bioawk，我們了解一下粉楚。 簡介 bioa...
發(fā)簡信
IP屬地：浙江
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35.《Bioinformatics Data Skills》之生物信息文本處理利器bioawk
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38.《Bioinformatics Data Skills》之命名管道與進(jìn)程替換
當(dāng)我們使用的程序輸入與輸出的是多個(gè)文件馁痴，無法使用管道命令黔漂。生物信息學(xué)的程序中這種情況實(shí)際是比較常見的订雾，假如說程序program需要2個(gè)輸入與2個(gè)輸出晴玖，那么其會(huì)產(chǎn)生4個(gè)中間結(jié)果...
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生信 | 基因組組裝實(shí)戰(zhàn)（六）：基因組質(zhì)量晶默、一致性谨娜、保守性、LAI等評(píng)估寫在前面 以下內(nèi)容均來自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培訓(xùn)班上記錄的課堂筆記 1.基因組組裝指標(biāo)評(píng)估 為什么...
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審稿意見回復(fù)技巧
技巧1：先禮后兵磺陡，禮貌開頭 Dear Editor and Reviewers, Thank you for your letter and for the reviewer...
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estimate 算法計(jì)算腫瘤純度
0.腫瘤純度[http://222.70.95.243:6893/files/ESTIMATE%E5%88%86%E6%95%B0/estimate.html#%E8%82%...
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GO富集之topGOtopGO手冊(cè)中的實(shí)例實(shí)現(xiàn) 手冊(cè)地址：http://bioconductor.uib.no/2.7/bioc/vignettes/topGO/inst/doc/topGO.p...
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RNA-Seq：差異表達(dá)分析及可視化上一篇已經(jīng)系統(tǒng)介紹了有參RNASeq上游分析趴梢，從測(cè)序數(shù)據(jù)fastq文件到最終生成表達(dá)矩陣。這一系列基本都是RNASeq通用常規(guī)分析币他，其下游差異表達(dá)及可視化則根據(jù)需求及...
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基因組注釋之從頭預(yù)測(cè)1.創(chuàng)建本地BLAST數(shù)據(jù)庫 使用makeblastdb程序坞靶，對(duì)上述FASTA格式的蛋白 質(zhì)序列進(jìn)行處理，建立本地BLAST數(shù)據(jù)庫蝴悉。makeblastdb -in ./uni...
