現(xiàn)在的第三代測序技術(shù)中，主要以PacBio公司的SMRT和Oxford的Nanopore技術(shù)為主。與前面的兩代技術(shù)比較狈究，第三代最主要的特點(diǎn)在于單分子測序薪夕，就是測序的過程無需進(jìn)...
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三代測序技術(shù)簡介 -
@魔球魔 這些都是在linux下進(jìn)行操作的语卤。win需要你先安裝linux的虛擬機(jī)挤忙，然后再分析霜威。
基因家族分析之orthofinder后續(xù)結(jié)果的R分析基因樹
利用orthofinder分析基因家族后，可以獲得genetree和speciestree 結(jié)果册烈。我們可以利用R包來可視化基因樹和物種數(shù)戈泼，并對其進(jìn)行簡單的編輯。 1.下載安裝...
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全基因組組裝赏僧，注釋與評估軟件集錦（更新于2020.03.20）
1.Assembly 1.1質(zhì)體基因組 1.1.1NOVOPlasty program language：Perl Reference： 10.1093/nar/gkw95...
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@嘩啦啦啦_5d8c 我暫時還沒有學(xué)會這個
6. 利用python計算蛋白序列中氨基酸出現(xiàn)的頻率
問題：假設(shè)存在一個蛋白序列seq 'MPKRKKMRLFEEDDEIRESLLGADNKDKDEDEDLQSDTENRTFLEDTDTV'挽绩，計算各個氨基酸出現(xiàn)的頻率。方法1：...
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8. python如何創(chuàng)建隨機(jī)序列
如何創(chuàng)建隨機(jī)序列 在python中的random.randint(a,b)用于生成一個指定范圍內(nèi)的整數(shù)驾中。其中參數(shù)a是下限唉堪，參數(shù)b是上限，生成的隨機(jī)數(shù)n: a <= n <= ...
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基因家族分析八(計算串聯(lián)重復(fù)基因KAKS值)1.準(zhǔn)備文件 即要是1肩民，2是一對串聯(lián)重復(fù)唠亚，就將其放在一個文件內(nèi)。在上一步獲得的文件持痰，一對重復(fù)基因是一行灶搜，所以我們就將兩列一行轉(zhuǎn)為一列兩行，并以兩行為準(zhǔn)分割文件，最后利用生成的...
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48個實(shí)用的生信在線工具在線工具一般具有“功能強(qiáng)大剿涮、操作簡單言津、無需安裝、用完就走”的特點(diǎn)取试，輕松實(shí)現(xiàn)“用別人的服務(wù)器分析自己的數(shù)據(jù)”悬槽。 基因結(jié)構(gòu)繪制 1.Exon-Intron Graphic Mak...
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使用MAKER進(jìn)行基因注釋(基礎(chǔ)入門）
在基因組注釋上，MAKER算是一個很強(qiáng)大的分析流程瞬浓。能夠識別重復(fù)序列初婆，將EST和蛋白序列比對到基因組，進(jìn)行從頭預(yù)測猿棉，并在最后整合這三個結(jié)果保證結(jié)果的可靠性磅叛。此外，MAKER還...
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7. 利用python計算核酸序列中各堿基的次數(shù)
問題：已知一個核酸序列為seq = "AATTGC" 利用python程序計算各個堿基出現(xiàn)的頻率。 方法2： 利用count函數(shù)杖爽，統(tǒng)計ATCG四種堿基的出現(xiàn)次數(shù)敲董。
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6. 利用python計算蛋白序列中氨基酸出現(xiàn)的頻率問題：假設(shè)存在一個蛋白序列seq 'MPKRKKMRLFEEDDEIRESLLGADNKDKDEDEDLQSDTENRTFLEDTDTV'，計算各個氨基酸出現(xiàn)的頻率慰安。方法1：...
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4. python學(xué)習(xí)之函數(shù)學(xué)習(xí)這是python自帶的函數(shù)泻帮。 如何定義一個函數(shù)精置？ 練習(xí)： 設(shè)置一個重量轉(zhuǎn)換器，輸入重量為20g锣杂，輸出為kg脂倦。
