GEOdatabase下載了一個.loom文件，想要用一下這個數據，折磨了一周劫乱，終于成功的將它轉換成了seurat對象辛友，現(xiàn)記錄如下：數據為GSE162183叉谜，地址：https...
IP屬地：天津
-
loom文件轉換成seurat對象 -
單細胞轉錄組高級分析六：TCGA生存分析
本文是參考學習單細胞轉錄組高級分析六：TCGA生存分析[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyMzMwNDQ2MA==&mid=22474...
-
clustree為聚類可視化在單細胞的研究中杰捂，經常需要做的就是聚類比驻。在聚類的時候庆猫，對于聚出多少個cluster认轨，一個相關的參數是resolution，當數值小的時候月培，cluster少嘁字，數值大的時候，cl...
-
FindClusters選擇多少resolution合適杉畜？日常瞎掰 ??昨天看到一個關于女孩找對象方面的笑話纪蜒，大概內容是這樣的：一個女孩天天為應該找一個什么樣的男朋友而糾結，于是這個女孩便向大師尋求幫助此叠。??“大師纯续，我應該找一個什么...
-
GEO單細胞數據讀取
1.有直接的標準10X數據（喜大普奔）解壓縮后可以得到三個文件（barcodes.tsv/genes.tsv/matrix.mtx），文件名修改到一模一樣例如：GSE1062...
-
disgenet2r:一個R包解決人類疾病分子功能的全部研究前言 Immugent在之前寫過一個推文：DisGeNET數據庫：人類疾病相關基因研究的百科全書[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4M...
-
IOBR:一個R包帶你走進數據挖掘的殿堂
鑒于前一段時間有小伙伴私聊 Immugent 說生信寶庫是不是專門只寫單細胞相關的推文呀灭袁，其實猬错，這只是湊巧最近發(fā)的都是單細胞相關的。雖然近幾年產生了大量的單細胞數據茸歧，但bul...
