GEOdatabase下載了一個(gè).loom文件，想要用一下這個(gè)數(shù)據(jù)，折磨了一周管搪，終于成功的將它轉(zhuǎn)換成了seurat對象，現(xiàn)記錄如下：數(shù)據(jù)為GSE162183杯瞻，地址：https...
IP屬地：天津
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loom文件轉(zhuǎn)換成seurat對象 -
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組高級分析六：TCGA生存分析
本文是參考學(xué)習(xí)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組高級分析六：TCGA生存分析[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyMzMwNDQ2MA==&mid=22474...
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clustree為聚類可視化在單細(xì)胞的研究中漏策，經(jīng)常需要做的就是聚類。在聚類的時(shí)候臼氨，對于聚出多少個(gè)cluster掺喻，一個(gè)相關(guān)的參數(shù)是resolution，當(dāng)數(shù)值小的時(shí)候储矩，cluster少感耙，數(shù)值大的時(shí)候，cl...
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FindClusters選擇多少resolution合適持隧？日常瞎掰 ??昨天看到一個(gè)關(guān)于女孩找對象方面的笑話即硼，大概內(nèi)容是這樣的：一個(gè)女孩天天為應(yīng)該找一個(gè)什么樣的男朋友而糾結(jié)，于是這個(gè)女孩便向大師尋求幫助屡拨。??“大師只酥，我應(yīng)該找一個(gè)什么...
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大佬，請問對于單表格的數(shù)據(jù)該怎么處理呢呀狼？
GEO單細(xì)胞數(shù)據(jù)讀取
1.有直接的標(biāo)準(zhǔn)10X數(shù)據(jù)（喜大普奔）解壓縮后可以得到三個(gè)文件（barcodes.tsv/genes.tsv/matrix.mtx）裂允，文件名修改到一模一樣例如：GSE1062...
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GEO單細(xì)胞數(shù)據(jù)讀取
1.有直接的標(biāo)準(zhǔn)10X數(shù)據(jù)（喜大普奔）解壓縮后可以得到三個(gè)文件（barcodes.tsv/genes.tsv/matrix.mtx）绝编，文件名修改到一模一樣例如：GSE1062...
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disgenet2r:一個(gè)R包解決人類疾病分子功能的全部研究前言 Immugent在之前寫過一個(gè)推文：DisGeNET數(shù)據(jù)庫：人類疾病相關(guān)基因研究的百科全書[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4M...
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IOBR:一個(gè)R包帶你走進(jìn)數(shù)據(jù)挖掘的殿堂
鑒于前一段時(shí)間有小伙伴私聊 Immugent 說生信寶庫是不是專門只寫單細(xì)胞相關(guān)的推文呀，其實(shí)凡资，這只是湊巧最近發(fā)的都是單細(xì)胞相關(guān)的砸捏。雖然近幾年產(chǎn)生了大量的單細(xì)胞數(shù)據(jù)，但bul...
