有的時候在做數(shù)據(jù)分析的時候泥彤，會用到各種各樣的分析軟件余境，而每個分析軟件又有與之相匹配的輸入文件格式拷淘。格式不對止邮，會很麻煩，有時候會出現(xiàn)錯誤的結(jié)果你稚，甚至就不能運(yùn)行程序瞬沦。而許多軟件之...
發(fā)簡信
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plink格式文件與vcf格式文件相互轉(zhuǎn)化
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看完這篇Linux基本的操作就會了
前言 只有光頭才能變強(qiáng) 這個學(xué)期開了Linux的課程了，授課的老師也是比較負(fù)責(zé)任的一位剿另◇锎福總的來說也算是比較系統(tǒng)地學(xué)習(xí)了一下Linux了~~~ 本文章主要是總結(jié)Linux的基礎(chǔ)...
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跟著Nature Genetics學(xué)作圖：使用ggarrange包對ggplot2的多個圖進(jìn)行組合論文 Plasma proteome analyses in individuals of European and African ancestry identify ci...
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【報告筆記】提高全基因組選擇精度的策略和應(yīng)用研究這個報告來自揚(yáng)州大學(xué)徐辰武老師贬蛙，比較系統(tǒng)地總結(jié)了他們在GS應(yīng)用于作物（主要是水稻）方面的研究，值得一看谚攒。 動物育種一般只考慮加性效應(yīng)阳准，而在植物育種中，除了加性效應(yīng)馏臭，往往還需考...
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自己構(gòu)建物種包OrgDb野蝇，然后用clusterProfiler富集分析
利用clusterProfiler進(jìn)行富集分析時，發(fā)現(xiàn)網(wǎng)上沒有物種包OrgDb括儒，利用網(wǎng)上教程構(gòu)建了一個绕沈。主要參考了劉小澤的簡書，特別感謝一下０镅啊ＵШ！ emapper首先得到注釋...
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FELLA:代謝組學(xué)富集分析軟件介紹導(dǎo)讀 通路富集分析技術(shù)對于理解代謝組學(xué)數(shù)據(jù)背后的潛在生物學(xué)意義是非常有用的固逗，它們的目的是根據(jù)代謝途徑中所包含的先驗(yàn)知識浅蚪，為受影響的代謝物提供上下游關(guān)系。然而抒蚜，對廣義代謝通路的...
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非模式生物KEGG富集分析寫在前面 因?yàn)槲已芯康奈锓N比較小眾掘鄙，很多注釋不完全，R包AnnotationHub中也沒有對應(yīng)信息嗡髓，所以無法使用公共數(shù)據(jù)庫進(jìn)行kegg富集分析操漠。所以自己嘗試使用KAAS造一個...
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使用clusterProfiler進(jìn)行富集分析clusterProfiler是業(yè)界大神Y叔寫的R包，看過了它的繪圖就會使人沉迷于其顏值無法自拔饿这。本文很多內(nèi)容直接翻譯自官方文檔浊伙，加上了我的測試數(shù)據(jù)（還是以果蠅為例）。 一长捧、...
