組學(xué)工具合集 整理了一些目前知道的與組學(xué)相關(guān)的工具奴拦,可能不全面,歡迎補(bǔ)充 基因組學(xué) 一代組裝 Celera Assembler: 最具代表性的工具 二代組裝 Minia SP...
最近剛返校绿鸣,事情比較多,每天也很忙暂氯,之前寫的《基因家族擴(kuò)張與收縮分析及物種進(jìn)化樹構(gòu)建(上)》也一直沒來得及更新潮模,缺少cafe輸出結(jié)果的解讀及后面的可視化。最近在簡(jiǎn)書上也收到了...
一、4Dtv(四倍簡(jiǎn)并位點(diǎn)顛換率)的定義 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
寫在前面 大量物種的基因組被報(bào)道辣吃,越來越多的公開可獲取數(shù)據(jù)动遭,使得我們可以針對(duì)自己的生物學(xué)問題,開展基本的比較基因組分析齿尽。鑒于此沽损,有必要搞一個(gè)工作臺(tái)式的功能。于是循头,我在飛機(jī)上寫...
寫在前面 對(duì)于沒有做過共線性分析的小伙伴国裳,可以通過以下幾段內(nèi)容,了解一下全跨,我為什么要費(fèi)勁巴拉畫出這樣一張圖缝左。 除了基因組成的相似性,在不同基因組中基因排列順序的一致性更能夠體...
Basic local alignment search tool (BLAST) 包括:blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等....