#需要用到的python包import numpy as npfrom prody import *bc=np.loadtxt("bc.txt") #用文本文檔格式儲(chǔ)存一列想...
IP屬地：臺(tái)灣
-
PyMoL:使用b-factor將變量映射到蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu) -
-
蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)窘行、結(jié)果解讀與評(píng)分蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)号杏，只要有目的基因的氨基酸序列就可以做续室，不限物種饲帅，沒(méi)有太多要求侵蒙，可為文章增色也榄。windows版本的VMD軟件可在公眾號(hào)生信星球回復(fù)“VMD”獲得惦费，且附帶軟件中...
-
超詳細(xì)教程趟脂！如何下載泰讽、安裝和運(yùn)行AlphaFold2前言： AlphaFold2在CASP14蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)關(guān)鍵評(píng)估大賽中奪得第一名的好成績(jī)，其預(yù)測(cè)的大部分結(jié)構(gòu)達(dá)到了空前的準(zhǔn)確度，與實(shí)驗(yàn)方法（X-ray已卸、冷凍電鏡佛玄、核磁...
-
關(guān)于如何分析進(jìn)化樹(shù)
參考1： http://blog.sina.com.cn/s/blog_1774c102e0102y3p7.html (1)水平方向：遺傳變量的變化程度水平方向上的分支代表進(jìn)...
-
SignalP 5.0：信號(hào)肽預(yù)測(cè)信號(hào)肽（signal peptides）：是引導(dǎo)新和成的蛋白質(zhì)向分泌通路轉(zhuǎn)移的短肽鏈，長(zhǎng)度約5-30個(gè)氨基酸累澡；對(duì)應(yīng)的mRNA序列梦抢，在起始密碼子后，有一段編碼疏水性氨基酸序列的...
-
2019-03-01 進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建-序列的篩選原則，利用進(jìn)化樹(shù)確定蛋白分類（為下一步想做的gene family準(zhǔn)備）
http://blog.sina.com.cn/s/blog_e6c5efde0101lgfi.html進(jìn)化樹(shù)以圖像的形式反映序列比對(duì)的結(jié)果蕊梧，但是有的時(shí)候霞赫，序列比對(duì)沒(méi)有辦法確...
-
如何利用NCBI預(yù)測(cè)基因的結(jié)構(gòu)域和保守位點(diǎn)1. 使用CD-Search工具來(lái)可以鑒定蛋白質(zhì)或者核酸序列內(nèi)的保守結(jié)構(gòu)域或功能單位。該工具位于NCBI中肥矢。具體我們可以進(jìn)入NCBI后選擇Conserved Domain然后...
-
通過(guò)多序列比對(duì)找到保守區(qū)域序列標(biāo)識(shí)圖 sequencelogo 工具使用 使用在線的工具端衰，WebLogo3 字母大小都是根據(jù)上方的運(yùn)算求得的，通常來(lái)說(shuō)出現(xiàn)次數(shù)多的字母甘改，體積也就越大旅东，而如果某一列只有一...
