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測序上游分析系列: mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達(dá)矩陣:上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline:從raw r...
你好驱还,想請教一下嗜暴,什么是數(shù)值化后的分類變量
TCGA+biomarker——單因素Cox回歸生存分析KM法與Cox法異同 KM 方法即Kaplan-Meier survival estimate是一種無參數(shù)方法(non-parametric)來從觀察的生存時(shí)間來估計(jì)...
今日學(xué)習(xí)重點(diǎn) 熟悉向量凸克、數(shù)據(jù)框的使用 理解元素、標(biāo)量闷沥、向量 變量賦值方法 從向量中提取元素 數(shù)據(jù)框的讀取萎战、設(shè)置行列名、導(dǎo)出舆逃、保存蚂维、加載 數(shù)據(jù)框中元素提取 利用數(shù)據(jù)框中數(shù)據(jù)作圖
Linux軟件管理工具conda conda 相當(dāng)于Linux的應(yīng)用商城特點(diǎn):方便快捷日常生信分析使用miniconda即可滿足 下載及安裝miniconda 下載1.1 進(jìn)...
學(xué)習(xí)框架 什么是Linux Linux是一種操作系統(tǒng)奔誓,類似于我們常用的windows系統(tǒng)和Mac系統(tǒng)斤吐,但是Linux在普通計(jì)算機(jī)或者筆記本中應(yīng)用相對較少,其市場主要集中在服務(wù)...
學(xué)習(xí)平臺(tái)的搭建 chrome瀏覽器插件 由于本人電腦使用的chrome瀏覽器無法直接進(jìn)入chrome的官方應(yīng)用商城臼婆,自行網(wǎng)上搜索了其他方法,具體教程可見如下鏈接:chrome...
你好颁独,我想請教一下,我按在運(yùn)行model_lasso <- glmnet(x, y,nlambda=10, alpha=1)這一步時(shí)出現(xiàn)了下面的錯(cuò)誤伪冰,應(yīng)該如何解決誓酒?
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TCGA學(xué)習(xí)04:建模預(yù)測-lasso回歸TCGA學(xué)習(xí)01:數(shù)據(jù)下載與整理 - 簡書 TCGA學(xué)習(xí)02:差異分析 - 簡書 TCGA學(xué)習(xí)03:生存分析 - 簡書 TCGA學(xué)習(xí)04:建模預(yù)測-cox回歸 - 簡書...
你好,如果GEO沒有提供整理好的ALL_data數(shù)據(jù),只有10x數(shù)據(jù)應(yīng)該怎么處理靠柑?(GSE136103)
生信技能樹單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘筆記(1)前言 最近有幸加入生信技能樹的單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘嘗鮮群[https://mp.weixin.qq.com/s/3XyA-DXRzL8JuJlnV3LW0Q],借此機(jī)會(huì)給大家分享一...
請教一下樓主歼冰,如果整理的臨床信息中存在缺失值應(yīng)該如何處理靡狞?
TCGA數(shù)據(jù)差異分析后生存分析(批量單因素cox回歸/Lasso篩選,多因素cox建模隔嫡,時(shí)間依賴ROC曲線及KM plot可視化)測序上游分析系列: mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達(dá)矩陣:上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline:從raw r...