下載序列簡單不過蔫饰，無非就是聯(lián)網(wǎng)NCBI主頁，選擇數(shù)據(jù)庫后輸入AC號或GI號后直接下載。但是如何大批量下載，而且下載的序列是指定的AC或GI的呢？實(shí)現(xiàn)這一目的通常辦法是借助一些...
IP屬地：重慶
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Batch Entrez｜批量從NCBI上下載基因序列 -
利用表達(dá)和染色質(zhì)可及性數(shù)據(jù)建模基因調(diào)控
原文：Modeling gene regulation from paired expression and chromatin accessibility data 引言 ...
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生信 | 構(gòu)建物種的OrgDb寫在前面 本文主要參考生信小白2018[http://www.reibang.com/p/bb4281e6604e]與多啦A夢的時光機(jī)[https://www.jiansh...
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轉(zhuǎn)錄組分析——STAR+RSEM+Deseq2STAR+RSEM+Deseq2視頻課程鏈接已經(jīng)公開, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=8[https://www...
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群體進(jìn)化-gwas分析 群體進(jìn)化基礎(chǔ)分析 PCA 分析原理PCA(Principal Component Analysis)，即主成分分析方法谒拴，是一種使用最廣泛的數(shù)據(jù)...
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富集分析后的結(jié)果如何畫chord弦狀圖
Chord Diagram弦狀圖-用來畫富集分析的結(jié)果 前面看的文獻(xiàn)中，有一個很漂亮的圈圖痢士，https://mp.weixin.qq.com/s/NIqSTvJ916ZGk_...
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motifmatchr: 在R語言中分析peak中里是否有motif匹配
motifmatchr的作用就是分析眾多的序列和眾多的motifs, 從中找到哪個序列包含哪個motif. 它的核心函數(shù)就是matchMotifs彪薛，最大特點(diǎn)就是快，因?yàn)樗玫?..
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2019-06-17 homer motif結(jié)果作氣泡圖
y<- read.table("motif-logP.txt",sep= "," , header= T) head(y) motif logPvalue type...
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測序結(jié)果概覽：基因表達(dá)量rank瀑布圖怠蹂，高密度表達(dá)相關(guān)性散點(diǎn)圖善延，注釋特定基因及errorbar的表達(dá)相關(guān)性散點(diǎn)圖繪制這是ggplot2可視化專題的第一個實(shí)例操作 ggplot2的基本思路見前文總論：基于ggplot2的RNA-seq轉(zhuǎn)錄組可視化：總述和分文目錄 【ggplot2繪圖具體策略...
