寫在前面 其實(shí)很多作者已經(jīng)探索的差不多了，相關(guān)腳本、教程也很多地回，但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧盾似。有時(shí)候感覺是浪費(fèi)時(shí)間仅淑，但是在寫的時(shí)候能發(fā)現(xiàn)并學(xué)習(xí)到很多新的知識捞慌，不斷記錄反思昌妹，也...
發(fā)簡信
IP屬地：北京
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生信 | ATAC-Seq基礎(chǔ)分析+高級分析+多組學(xué)分析 -
funkyheatmap |臨床+組學(xué)+分組數(shù)據(jù)可視化“神器”甘凭，時(shí)髦的熱圖
|本文首發(fā)于“生信補(bǔ)給站”公眾號稀拐，https://mp.weixin.qq.com/s/04FA3O4QVwg9CNtHBWbUYw[https://mp.weixin.qq...
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這個(gè)世界流行離開德撬，但我們卻不擅長告別
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Seurat識別細(xì)胞類群的原理（FindNeighbors和FindClusters）眾所周知，seurat在降維之后主要依據(jù)兩個(gè)函數(shù)來進(jìn)行細(xì)胞分類躲胳，這里我們來深入了解一下seurat如何進(jìn)行細(xì)胞分類的蜓洪。首先我們來看有關(guān)分類的兩個(gè)函數(shù) 我們來一一解決其中的問題...
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10X單細(xì)胞測序分析軟件:Cell ranger單細(xì)胞測序有著漫長的過去粹湃，卻只有短暫的歷史---誰說的刚操！ 說她漫長是因?yàn)榈饺缃褚灿惺畮啄甑臍v史了，說她段短暫是因?yàn)獒槍渭?xì)胞的分析工具越來越有意義開發(fā)周期卻越來越短再芋。一般生物...
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中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院-基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)博士在讀<br>歡迎關(guān)注個(gè)人公眾號<br><br>公眾號：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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tidyverse|數(shù)據(jù)分析常規(guī)操作-分組匯總（sumamrise+group_by)
| 本文首發(fā)于“生信補(bǔ)給站” https://mp.weixin.qq.com/s/tQt0ezYJj3H7x3aWZmKVEQ 一 summarise 匯總 匯總函數(shù) su...
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@沙卡巴卡 哦哦……抱歉畅姊，那時(shí)候還不會……后面的推文就是MD寫的了??
pheatmap|暴雨暫歇，“熱圖”來襲４涤伞Ｈ粑础！
熱圖可以聚合大量的數(shù)據(jù)倾鲫，并可以用一種漸進(jìn)色來優(yōu)雅地表現(xiàn)粗合，可以很直觀地展現(xiàn)數(shù)據(jù)的疏密程度或頻率高低。 本文利用R語言pheatmap包從頭開始繪制各種漂亮的熱圖乌昔。參數(shù)像積木隙疚，拼...
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LDheatmap | SNP連鎖不平衡圖（LD）可視化，自己數(shù)據(jù)實(shí)現(xiàn)版磕道！
本文首發(fā)于“生信補(bǔ)給站”供屉，https://mp.weixin.qq.com/s/Gl6BChxSYbSHMo9oMpufPg 連鎖不平衡圖，用來可視化不同SNP之間的連鎖程度...
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R-ggpmisc|回歸曲線添加回歸方程捅厂，R2贯卦，方差表资柔，香不香焙贷？
本文首發(fā)于“生信補(bǔ)給站”，https://mp.weixin.qq.com/s/_rTWJHcbUu2Eqtex74gUBA 散點(diǎn)圖繪制回歸曲線很常用贿堰，那么添加上回歸方程辙芍，P...
