Cutadapt安裝 基本命令 例子： 常用參數(shù) 參數(shù)詳解 Removing adapters Adapter 移除 Anchored 5’ adapters：adapter...
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cutadapt 使用詳解 -
【生信工具】seqkit-fa&fq文件處理利器作為生信入門訓練，我們常用perl python等腳本語言實現(xiàn)對基因組文件的處理硫豆，練習常規(guī)的文本文件處理。最近再做單細胞方面的技術開發(fā)臣樱，需要自己手動合成一個嵌合兩種物種的基因...
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Conda安裝qiime2（目前最有效的方法）一限煞、環(huán)境 linux-ubuntuanaconda3/miniconda 二抹恳、實操演示 1.conda是安裝QIIME2的首選工具，但是很多國內的朋友苦于無法鏈接網絡問題導致...
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5. 基于OTUs的alpha多樣性指數(shù)計算和可視化簡介 1. 物種豐富度指數(shù)(Species richness)：群落中豐度大于0的物種數(shù)之和疤坝，一般用Observed OTU(observed species)表示兆解，只有物種...
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R包安裝、卸載的多種方式本期內容 查看及修改R包的安裝路徑 修改安裝包的默認鏡像源 R包的多種安裝方式 R包卸載 以下如無特殊說明卒煞，命令都是在R中運行 查看及修改R包的安裝路徑 重啟R痪宰，再次查看安裝...
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R及R包安裝衣撬、更新、卸載扮饶、刪除
更新R 更新R包 更新所有R包如果用的是Rstudio具练，要更新library里所有包，一種方法是點擊Tools甜无，選擇Check for Package Updates即可扛点。 ...
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樓主您好陵究，我在測試的時候最后四行代碼出現(xiàn)報錯
Error: object 'rowtype' not found
Error: object 'coltype' not foundComplexheatmap::pheatmap繪圖字體設置
ComplexHeatmap是一個很好用的繪制熱圖的R包眠饮。這篇文章主要介紹Complexheatmap::pheatmap繪圖字體設置。在原函數(shù)中沒有設置字體的參數(shù)铜邮。查看有關...
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Complexheatmap::pheatmap繪圖字體設置ComplexHeatmap是一個很好用的繪制熱圖的R包仪召。這篇文章主要介紹Complexheatmap::pheatmap繪圖字體設置。在原函數(shù)中沒有設置字體的參數(shù)松蒜。查看有關...
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perl腳本練習：fasta格式與tab格式序列之間相互轉換(2)(適用范圍更廣)
前言 我的認知里扔茅，fasta格式中“>”只會位于行首。但是我寫腳本用的示例數(shù)據里出兩行特殊id秸苗。這兩個id中除了行首的“>”召娜，中間還有“>”，造成原腳本不能適用惊楼。所以在腳本里...
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生信分析之基因富集分析（GeneSet Enrichment Analysis)
01 基因富集分析基本概念 今天我們來講一講什么是基因富集分析 首先我們要抓住一個核心胁后，那就是： “將我們挑出來的基因歸歸類店读，聚類分析，看看這些基因的功能和我們的研究是否具有...
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微生物組16S rRNA數(shù)據分析小結：從OTU table到marker物種筆記內容：由二代測序產生的序列數(shù)據（.fastq）到OTU table， 距離矩陣侣诺，物種多樣性指數(shù)殖演，序列的進化樹及物種注釋信息的可分析數(shù)據，為常規(guī)分析流程年鸳∨烤茫可以使用usear...
