發(fā)簡信
IP屬地：北京
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第3篇：用MACS2軟件call peaks學(xué)習(xí)目標(biāo)： 學(xué)會用MACS2 call peaks 理解MACS2 call peaks的結(jié)果 Peak Calling Peak calling即利用計算的方法找出ChIP...
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ATAC-seq分析實(shí)操生信技能樹健明教程放在最前面的參考鏈接：給學(xué)徒的ATAC-seq數(shù)據(jù)實(shí)戰(zhàn)（附上收費(fèi)視頻) 數(shù)據(jù)來源的文章： The landscape of accessible chromatin in m...
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bwa+samtools+picardtools+GATK call SNP 流程call SNP GATK bwa+samtools 參考文檔 一刽沾、原始數(shù)據(jù)處理 測序得到的RAW DATA锐借，使用NGSQCToolkit進(jìn)行過濾$PATH/Il...
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談?wù)勎覀兌紣塾玫南嚓P(guān)系數(shù)當(dāng)師兄和老師就應(yīng)該選取哪一個相關(guān)系數(shù)討論時障本，我發(fā)現(xiàn)我插不上話棋电。這對于具有話癆體質(zhì)的我栗涂，怎么能忍摇锋？為了能在組會上多噴幾句丹拯，我寫下了這篇文章…… 太長不看系列 線性關(guān)系使用Pea...
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GTF與GFF文件格式的區(qū)別與轉(zhuǎn)換
GTF與GFF文件都是用于存儲注釋信息的文本類型站超，經(jīng)常可以看到二者格式之間的相互轉(zhuǎn)換咽笼。二者的名字相似顷编，連內(nèi)容都極為相似，那么二者的差異究竟在哪里呢剑刑？ GFF (general...
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清華鏡像沒了媳纬，我們怎么辦？
? 清華鏡像近日發(fā)布了一條關(guān)于停止Anaconda鏡像服務(wù)的通知施掏，很不幸钮惠，在此之前我一直使用的是清華鏡像源，于是可憐的我只能另覓它法…… 如果你不知道自己的anacon...
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DNA鏈方向上的小疑惑
雖然是做生物信息的，但是經(jīng)常被一些基礎(chǔ)性概念所困擾……而我又是一個強(qiáng)迫癥耙箍，于是把這些亂七八糟的東西整理了一下撰糠，強(qiáng)行寫了一篇小文章。東西太雜辩昆，但是彼此相關(guān)阅酪，實(shí)在想不到什么合適的...
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討厭又迷人的reads去重復(fù)在NGS分析入門階段，我們不需要考慮太多的細(xì)節(jié)汁针，只用知道一個分析的大致流程并完整跑下來即可术辐。太多的細(xì)節(jié)，只會讓我們對于分析產(chǎn)生莫須有的恐懼施无，因此一些“無關(guān)緊要“細(xì)節(jié)就被我們刻...
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python工具：jupyter notebookpython代碼工具我在用的有： python shell pycharm sublime text jupyter notebook 桌面功能多的還是sublime tex...
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TCGA數(shù)據(jù)挖掘三：針對不同因素和不同方法的生存分析加載并處理數(shù)據(jù) 針對臨床資料某一因素较屿，如年齡，性別等進(jìn)行生存分析卓练，并畫圖 針對基因的生存分析：方法一：挑選感興趣的基因做生存分析 針對基因的生存分析：方法二：批量生存分析 使...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)筆記-9-每個細(xì)胞檢測到的基因數(shù)量差異劉小澤寫于19.7.5-第二單元第七講：每個細(xì)胞檢測到的基因數(shù)量差異 筆記目的：根據(jù)生信技能樹的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組課程探索smart-seq2技術(shù)相關(guān)的分析技術(shù)課程鏈接在：http...
