跟著Cell學(xué)作圖|12.韋恩圖(Vennerable包) “實(shí)踐是檢驗(yàn)真理的唯一標(biāo)準(zhǔn)嘱朽∧土浚”“復(fù)現(xiàn)是學(xué)習(xí)生信的最好辦法稽坤。” DOI: 10.1016/j.cell.2020.0...
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跟著Cell學(xué)作圖|12.韋恩圖(Vennerable包) -
clustree ： 聚類可視化利器我們知道在研究問題時(shí)伞矩，分組是很重要的，有分組才有故事可講。比如络拌，兩塊田一塊施肥一塊不施肥，可以做比較嘛回溺。在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中用到較多的數(shù)據(jù)分組技術(shù)是聚類（clustering）...
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生信小白教程之Count轉(zhuǎn)TPM春贸，F(xiàn)PKM相信很多科研工作者（不包括比我厲害的大佬們）在做轉(zhuǎn)錄組時(shí)，都是在公司做測(cè)序遗遵，然后數(shù)據(jù)也交給公司分析萍恕，又然后，期待做個(gè)差異分析车要，得出像下圖那么完美的熱圖允粤。 然而，然而翼岁，类垫，我們得...
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單細(xì)胞 | 單細(xì)胞數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換：Converting from loom/h5ad to Seurat最近看到Fly Cell Atlas (FCA) 公布果蠅的多個(gè)組織的單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)，雖然FCA組織提供了多個(gè)在線平臺(tái)（例如SCope）進(jìn)行非常方便的可視化和多種分析...
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單細(xì)胞分析實(shí)錄(12): 如何推斷腫瘤細(xì)胞
公眾號(hào)后臺(tái)回復(fù)20210418琅坡，獲取本文的測(cè)試數(shù)據(jù) 1. 回顧 前面我已經(jīng)講解了inferCNV的基本用法[http://www.reibang.com/p/c01f56b...
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Django 實(shí)現(xiàn)分頁(yè)功能當(dāng)頁(yè)面因需要展示的數(shù)據(jù)條目過多阔挠，導(dǎo)致無(wú)法在一個(gè)頁(yè)面全部顯示。這時(shí)脑蠕，頁(yè)面經(jīng)常會(huì)采用分頁(yè)形式進(jìn)行展示购撼，然后每頁(yè)顯示 20 或者 50 等條數(shù)據(jù)。分頁(yè)經(jīng)常在網(wǎng)站上隨處可見谴仙，它大概是...
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Django實(shí)現(xiàn)分頁(yè)和表格搜索功能前言：在百度上查找django分頁(yè)功能非常之多迂求，但可用的技術(shù)文檔寥寥無(wú)幾。分頁(yè)雖說只是我們開發(fā)項(xiàng)目中一個(gè)很小的功能晃跺，但實(shí)現(xiàn)它是十分必要且必須的揩局。因?yàn)閷?shí)現(xiàn)分頁(yè)功能，能使我們更加...
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單細(xì)胞分析實(shí)錄(14): 細(xì)胞類型注釋的另一種思路 — CellID
之前寫過一篇細(xì)胞類型注釋的推文：?jiǎn)渭?xì)胞分析實(shí)錄(7): 差異表達(dá)分析/細(xì)胞類型注釋[http://www.reibang.com/p/1887dbd8d9e4]掀虎，里面介紹了...
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整理從TCGA下載的數(shù)據(jù)
如果從TCGA官網(wǎng)網(wǎng)頁(yè)下載數(shù)據(jù)凌盯，或者使用gdc-client工具下載的數(shù)據(jù)，都是以單個(gè)的文件夾形式存儲(chǔ)烹玉，并且文件夾中的為壓縮文件驰怎，所以，下載數(shù)據(jù)后二打，第一步就是如何把這些文件復(fù)...
