由于基因表達(dá)跟細(xì)胞表面蛋白的表達(dá)具有時(shí)間差，所以要根據(jù)經(jīng)驗(yàn)具體情況具體分析，內(nèi)容僅供參考 ??哺乳類動(dòng)物B細(xì)胞的分化過程主要可分為前B細(xì)胞、不成熟B細(xì)胞、 成熟B細(xì)胞语婴、活化B...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：四川
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【單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組】人類B細(xì)胞亞群分析Marker基因匯總 -
單細(xì)胞分析識(shí)別控制B細(xì)胞發(fā)育和轉(zhuǎn)化的動(dòng)態(tài)基因表達(dá)網(wǎng)絡(luò)
2021年11月25日，美國明尼蘇達(dá)大學(xué)實(shí)驗(yàn)室醫(yī)學(xué)和病理學(xué)系的研究人員在Nature Communications雜志上發(fā)表了“Single-cell analysis id...
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單細(xì)胞seurat學(xué)習(xí)筆記計(jì)算各個(gè)cluster的細(xì)胞數(shù)繪制堆疊條形圖
計(jì)算各個(gè)cluster的細(xì)胞數(shù)； table(Idents(pbmc)) 定義對(duì)應(yīng)每個(gè)cluster對(duì)應(yīng)的細(xì)胞類型首有，也可將ident改為相應(yīng)的細(xì)胞類型燕垃，計(jì)算每個(gè)細(xì)胞類型的細(xì)胞...
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10X單細(xì)胞空間聯(lián)合分析之cell2location的詳細(xì)梳理又是周五，馬上元旦井联，不知道大家打算怎么跨年呢利术？但是，今天還是工作日低矮，我們還是要學(xué)習(xí)學(xué)習(xí)印叁，不負(fù)韶華。 這一篇還是想詳細(xì)梳理一下cell2location军掂，包括算法以及代碼的寫法...
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使用scVelo進(jìn)行RNA velocity分析-01scVelo于2020年發(fā)表在Nature Biotechnology[https://www.nature.com/articles/s41587-020-0591-3]轮蜕，...
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LOH雜合性缺失簡(jiǎn)介
歡迎關(guān)注"生信修煉手冊(cè)"！ LOH全稱Loss of heterozygosity蝗锥， 中文名叫做雜合性缺失跃洛。 以human為例，正常體細(xì)胞中有兩個(gè)染色體組终议，一對(duì)等位基因的al...
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OS/PFS/PFI/DFS/DFI/DSS各種生存指標(biāo)定義
OS 總體生存期： Overall Survival 定義： 結(jié)局指標(biāo)是死亡時(shí)間汇竭，這個(gè)死亡是任何原因?qū)е碌乃劳龆妓氵M(jìn)去，只關(guān)心是否死亡穴张，不關(guān)心因?yàn)楹畏N原因死亡细燎。優(yōu)點(diǎn) ： 能比...
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用clusterProfiler進(jìn)行GSEA分析
****今天來關(guān)注如何使用clusterProfiler系列包來分析GSEA** 導(dǎo)入包，導(dǎo)入數(shù)據(jù) 今天比昨天多導(dǎo)入了一個(gè)ReactomePA包皂甘，這個(gè)包也是Y叔開發(fā)用來分析R...
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seurat-FindAllMarkers()源碼解析現(xiàn)在回想單細(xì)胞項(xiàng)目的一些常規(guī)分析玻驻，clusters/groups間的差異表達(dá)分析（differential expression analysis）幾乎是分析必備項(xiàng)，F(xiàn)ind...
