關(guān)于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組轉(zhuǎn)錄因子的分析我們之前在單細(xì)胞系列講過R語言版本的，參考：跟著Cell學(xué)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析(十二):轉(zhuǎn)錄組因子分析[http://mp.weixin.qq.co...
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PySCENIC（一）：python版單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組轉(zhuǎn)錄因子分析
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R語言|Cox模型校準(zhǔn)度曲線繪制轉(zhuǎn)自個人微信公粽號【易學(xué)統(tǒng)計】的統(tǒng)計學(xué)習(xí)筆記：R語言實現(xiàn)Cox模型校準(zhǔn)度曲線繪制[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU4MjgyODQzN...
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單細(xì)胞交響樂17-不同單細(xì)胞R包的數(shù)據(jù)格式相互轉(zhuǎn)換劉小澤寫于2020.7.18為何取名叫“交響樂”寡键？因為單細(xì)胞分析就像一個大樂團(tuán)，需要各個流程的協(xié)同配合單細(xì)胞交響樂1-常用的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)SingleCellExperiment單...
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單細(xì)胞之富集分析-2：批量GSEA和GSVA分析單細(xì)胞富集分析系列： 單細(xì)胞之富集分析-1：單細(xì)胞GSEA分析流程[http://www.reibang.com/p/00f069cb239c] 1. 背景 Gene Se...
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67-R中dataframe與list的轉(zhuǎn)換
內(nèi)容概覽 1况既、dataframe轉(zhuǎn)換為list-- 1.1. 每一列作為list的一個元素-- 1.2. 每一行作為list的一個元素-- 1.3. 對行進(jìn)行分組，每一組作為...
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安裝ComplexHeatmap報錯组民，cairo安裝問題ComplexHeatmap安裝了之后棒仍，加載一直報錯，報錯信息如下： 看樣子是Cairo 沒有加載上嘗試安裝加載 安裝正常臭胜，還是加載報錯 首先百度各種消息唯一可能有效的是簡書...
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纖維化機(jī)制：Myofibroblast的來源和功能1. 簡介 纖維化是由肌成纖維細(xì)胞在慢性炎癥反應(yīng)中過度沉積細(xì)胞外基質(zhì)（ECM）蛋白引起的疤痕和組織硬化莫其。多種有害刺激（包括毒素、傳染性病原體耸三、自身免疫反應(yīng)和機(jī)械應(yīng)激）能夠誘導(dǎo)...
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TCGA文章復(fù)現(xiàn)——LncRNA-CRC預(yù)后Title:An Integrated Three-Long Non-coding RNA Signature Predicts Prognosis in Colorecta...
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TCGA數(shù)據(jù)的一致性聚類實戰(zhàn)和可視化通過不同的聚類算法乱陡，依據(jù)不同的基因或指標(biāo)給樣本聚類，是數(shù)據(jù)挖掘文章里面經(jīng)常出現(xiàn)的操作咯仪壮。接下來要寫寫不同聚類方法的介紹和代碼實現(xiàn)啦憨颠。 1.輸入數(shù)據(jù) 目前從網(wǎng)上找到的代碼大多是...
