發(fā)簡信
IP屬地：重慶
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GO和Pathway富集分析的背景基因集
功能(GO)或者通路(Pathway)富集分析時藕坯，都會涉及到 Background; 做分析時，分析工具會提供一些數(shù)據(jù)供使用者選擇或者使用自定義的gene list噪沙。 例如炼彪，...
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Conda clean 凈化Anaconda
conda 安裝的包都在目錄Anaconda/pkgs下。隨著使用正歼，conda 安裝的包也越來越多辐马；有時候會出現(xiàn)以下不好的情況： 有些包安裝之后，從來沒有使用過局义； 一些安裝包...
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ChIP-Seq數(shù)據(jù)挖掘系列-1: Motif 分析(1) - HOMER 安裝
HOMER 是一套用于Motif查找和二代數(shù)據(jù)分析的工具喜爷。HOMER 中的工具是使用Perl 和C++編寫的，適用于unix操作系統(tǒng)萄唇￠菡剩基于motif尋找的算法，HOMER 適...
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ChIP-Seq數(shù)據(jù)挖掘系列-2: Motif 分析(2) - HOMER Motif 分析基本步驟在基因組調控元件分析中另萤，HOMER 可以用于發(fā)現(xiàn)新的motif湃密。HOMER 通過比較兩個序列集，再使用ZOOPS scoring (zero or one occurrenc...
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ChIP-Seq數(shù)據(jù)挖掘系列-3: Motif 分析(3) - 利用ChIP-Seq結果在基因組區(qū)域中尋找富集的Motifs# findMotifsGenome.pl: 在基因組區(qū)域中尋找富集Motifs HOMER 最初設計的目的用于ChIP-Seq peaks 中尋找富集motifs 仲墨。 #命...
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轉錄組入門(3)：了解fastq測序數(shù)據(jù)
轉錄組入門(3)：了解fastq測序數(shù)據(jù)需要用安裝好的sratoolkit把sra文件轉換為fastq格式的測序文件勾缭，并且用fastqc軟件測試測序文件的質量！作業(yè)目养，理解測序...
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可以把FastQC工具加上，很好用
轉錄組入門(3)：了解fastq測序數(shù)據(jù)
轉錄組入門(3)：了解fastq測序數(shù)據(jù)需要用安裝好的sratoolkit把sra文件轉換為fastq格式的測序文件毒嫡，并且用fastqc軟件測試測序文件的質量癌蚁！作業(yè)幻梯，理解測序...
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很實用
轉錄組入門（2）：讀文章獲取測序數(shù)據(jù)
本系列課程學習的文章是：AKAP95 regulates splicing through scaffolding RNAs and RNA processing facto...
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R語言——heatmap（一）heatmap各個參數(shù)含義 # data scaling處理數(shù)據(jù) 此部分源出處網(wǎng)址：http://www.docin.com/p-1847146477.html scale ...
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厲害厲害
轉錄組入門（1）：計算機與軟件準備
課程來源于生信技能樹：http://www.biotrainee.com/forum.php?mod=viewthread&tid=1750#lastpost 最好是有mac...
