要做選擇性消除分析馍刮，首先就要把如下的理論記住熟記于心信夫。 中性進(jìn)化假說： 分子水平上，生物的演化或物種的進(jìn)化并不是自然選擇引起的卡啰，而是由中性/近中性的突變等位基因經(jīng)過遺傳漂變引...
發(fā)簡信
IP屬地：吉林
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群體進(jìn)化選擇消除分析 -
每周一更 模仿生物信息學(xué)相關(guān)的文獻(xiàn)做實(shí)驗(yàn)匈辱，學(xué)習(xí)生物信息學(xué)處理數(shù)據(jù)解決生物問題的知識(shí)
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作為生信菜鳥梅誓，雖然之前用 R 畫了不少圖恰梢，但經(jīng)常是現(xiàn)用現(xiàn)學(xué)，感覺 R 的知識(shí)不系統(tǒng)梗掰，之后系統(tǒng)的學(xué)習(xí)一下 R 語言嵌言。在這里把讀書筆記整理出來，入門書籍包括《R 語言編程藝術(shù)》及穗、《ggplot2：數(shù)據(jù)分析與圖形藝術(shù)》摧茴、《R 語言實(shí)戰(zhàn)》、《R 語言與 Bioconductor 生物信息學(xué)應(yīng)用》埂陆。
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記錄學(xué)習(xí)生信的點(diǎn)滴
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生信技能樹：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公眾號(hào)：優(yōu)雅R 生物數(shù)據(jù)分析QA，技術(shù)文檔與博客鹃栽，需要你的參與躏率。 ……………………………… 歡迎在簡書創(chuàng)作和做筆記的生信學(xué)習(xí)者、愛好者以及相關(guān)編程人員加入本專題，貢獻(xiàn)你的文字薇芝，無論是原創(chuàng)還是筆記蓬抄，我們需要你，將本專題打造為生信知識(shí)寶庫夯到、交流平臺(tái)嚷缭。 內(nèi)容可以是對生物信息學(xué)與算法知識(shí)相關(guān)資源的收集、整理耍贾，以及原創(chuàng)筆記： * R * Python * Perl * Linux 工具與編程 * 繪圖 * 統(tǒng)計(jì) * 計(jì)算生物學(xué) * 各類算法 * 機(jī)器學(xué)習(xí)
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一條小咸魚
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Beast系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和分化時(shí)間的估算(上)以下內(nèi)容參考了同研究組師弟整理的筆記仍翰、和網(wǎng)絡(luò)資源：Beast v1.8簡易手冊-修訂版 · 語雀 (yuque.com)[https://www.yuque.com/wush...
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基于VCF文件做基因滲入分析(Dsuite)Dsuite軟件文章：Malinsky, M., Matschiner, M. and Svardal, H. (2021) Dsuite ‐ fast D‐statisti...
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RAxML 構(gòu)建進(jìn)化樹
1. RAxML 簡介 RAxML (Random Axelerated Maximum Likelikhood) 能使用多線程或并行化使用最大似然法構(gòu)建進(jìn)化樹越平。 2. RA...
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男黄琼，某西北高校博士在讀樊销，摸魚專業(yè)戶。
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章够吩。感謝這些簡友整理的生信分析流程比然！ 如果簡友投稿沒有被我收入專題，可能是我沒看到或者收入到其他針對性更強(qiáng)的專題中了周循。望見諒强法！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時(shí)候請點(diǎn)擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看湾笛。 ?? 全基因組測序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq饮怯、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python嚎研、perl蓖墅、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫的挖掘方法临扮，比如TCGA數(shù)據(jù)庫的使用 ?? 另外就是整個(gè)文章走下來的流程 ?? ?? ??
