利用python的xml包喇伯，對kegg的xml數(shù)據(jù)進行提取喊儡。根據(jù)這些數(shù)據(jù)，可以實現(xiàn)代謝路徑的數(shù)據(jù)整合艘刚、重構(gòu)或解析管宵。 在這里沒有對ElementTree的用法進行系統(tǒng)的解析。具...
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利用python提取kegg的xml文件信息
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基于代謝物和代謝物反應(yīng)的Gephi網(wǎng)絡(luò)分析過程1.excel中代謝物簡化 【注意】以下過程為vba編程 1.1 excel格式模板 1.2 vba代碼 替換結(jié)束后攀甚，手動將反應(yīng)簡寫列和反應(yīng)式列粘貼至Sheet3 2. 化合...
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Perl語言極簡多線程的實現(xiàn)
Threads不用說肯定是最經(jīng)典的多線程管理箩朴，但是如果你有以下需求： 我就想設(shè)置一個數(shù)，比如8秋度，之后我大循環(huán)每次開始8個線程同時工作炸庞，哪個跑完了再補一個，保持有最大8個線程工...
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Ubuntu修改CPAN源
網(wǎng)上的教程基本都在說usr里面改config.pm荚斯，然鵝應(yīng)該是perl改版了埠居，所以路徑下并沒有。 Ubuntu平臺的位置在：~/.cpan/CPAN/MyConfig.pm把...
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Ubuntu16.04極簡配置Tensorflow GPU環(huán)境折騰了一周多事期，終于發(fā)現(xiàn)了一個炒雞簡單的方法＝-＝滥壕，最后一行命令裝好全部環(huán)境。 環(huán)境的Ubuntu16.04兽泣，Windows的話差不多绎橘，總的來說就是用cuda裝超級容易。 ?先...
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Ubuntu安裝Tensorflow-GPU報錯處理
先說幾個坑： 1. 從Nvidia官網(wǎng)下周CUDA一定看準版本唠倦，10.0千萬別下成10.1這種 2. 安裝好cuDNN幾個配置環(huán)境 export LD_LIBRARY_PAT...
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普通博士如何找海外博士后
又是一年畢業(yè)季称鳞，新畢業(yè)的博士開始準備找博后涮较。本文根據(jù)自己的教訓(xùn)整理了一些如何做找生物（生物信息學(xué)）博士后的經(jīng)驗。 首先要明確的是冈止，博后只是一個過渡階段狂票，是對將來準備在研究道路...
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基因結(jié)構(gòu)圖-分分鐘學(xué)會小編今天給大家介紹一款在線繪制基因結(jié)構(gòu)的工具Gene Structure Dispaly Server，簡單好用功能還挺強大熙暴。運用它能夠繪制清晰的基因結(jié)構(gòu)闺属，清晰明了地展示外顯...
