發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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研究生一枚橱赠，主要研究方向?yàn)橹参飪?nèi)生菌及微生物相關(guān)內(nèi)容，公眾號(hào)【科研后花園】箫津，主要更新內(nèi)容：1）基于R的科研繪圖狭姨；2）科研小技巧分享；3）繪圖技巧分享苏遥；4）科研網(wǎng)站分享饼拍。
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EGFR罕見(jiàn)變異再探究，助力臨床精準(zhǔn)用藥肺癌仍然是全球癌癥死亡的最常見(jiàn)原因田炭，其中NSCLC占80%-85%师抄。EGFR（表皮生長(zhǎng)因子受體）是一種跨膜酪氨酸激酶受體，位于細(xì)胞膜上教硫，是一種重要的成員叨吮，屬于酪氨酸激酶受體家...
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RNA-seq入門(mén)實(shí)戰(zhàn)（零）：RNA-seq流程前的準(zhǔn)備——Linux與R的環(huán)境創(chuàng)建前言：進(jìn)行RNA-seq入門(mén)實(shí)戰(zhàn)首先需要有一定的linux與R基礎(chǔ)茶鉴，推薦跟著B(niǎo)站生信技能樹(shù)-jimmy老師學(xué)習(xí)打牢基礎(chǔ)：【生信技能樹(shù)】生信人應(yīng)該這樣學(xué)linux(更新至第14...
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測(cè)序數(shù)據(jù)的深度锋玲、覆蓋度等計(jì)算Coverage Depth 覆蓋深度 mapping depth 基因組被測(cè)序片段（短讀 short reads）“覆蓋”的強(qiáng)度有多大？ 每一堿基的覆蓋率是基因組堿基被測(cè)序...
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組裝 → 分類(lèi)注釋→下游分析涵叮， 按步驟幫你整理宏基因組生信分析工具
土壤微生物組分析工具 2020年1月出版的SpringerBriefs in Environmental Science叢書(shū)（電子版）《Unravelling the Soi...
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聚焦「 數(shù)據(jù)科學(xué) | 深度學(xué)習(xí) | 生命科學(xué) | Python | 機(jī)器學(xué)習(xí) 」等前沿交叉學(xué)科，定期分享理論教程與應(yīng)用實(shí)踐等穆刻。
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2022微生物組學(xué)擴(kuò)增子數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn)pipeline內(nèi)部培訓(xùn)資料（2022.10.29） QIIME 2分析實(shí)例--人類(lèi)腸癌不同部位微生物多樣性分析 “Moving Pictures” tutorial 熊金波實(shí)驗(yàn)室出品 ??...
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拷貝數(shù)變化CNV分析神器：CNVpytor簡(jiǎn)介概要 根據(jù)RD(Read Depth)來(lái)檢測(cè)CNV(copy number variations)和CNA(copy number alterations) 是CNVnato...
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從 fasta 創(chuàng)建用于 GATK 流程的 interval list
GATKbundle 提供了用于 WGS 的 interval list 文件飞傀，但如果你用的參考基因組跟他提供的 interval list 不一致，比方說(shuō) Contig 命...
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samtools常用命令詳解
samtools是一個(gè)用于操作sam和bam文件的工具集合诬烹。 1. view view命令的主要功能是：將輸入文件轉(zhuǎn)換成輸出文件砸烦，通常是將比對(duì)后的sam文件轉(zhuǎn)換為bam文件，...
