這個(gè)只針對人類的嗎畅蹂?有其它
物種的不?
GWAS分析-說人話(15)- 如何查看SNP所在的基因前言 當(dāng)我們獲得一堆“感興趣”/“有意義”的SNPs之后荣恐, 怎樣知道這些SNPs所在的基因呢液斜? 不要告訴我一個(gè)一個(gè)在pubmed查就好~ 我們需要知道Plink哪個(gè)參數(shù)可以幫...
你好,請問下如何計(jì)算每個(gè)PCA的占比率呢募胃?
「群體遺傳學(xué)實(shí)戰(zhàn)」第二課: 畫出和文章幾乎一樣的PCA圖主成分分析(PCA)是一種線性降維方法旗唁,能從紛繁復(fù)雜的數(shù)據(jù)中抽離出關(guān)鍵因素,用來區(qū)分不同的樣本痹束。這里我們不談PCA背后的數(shù)學(xué)原理检疫,只談哪些軟件能夠處理數(shù)據(jù),我找到了以下三款 ...
在群體遺傳學(xué)研究中论巍,LD連鎖不平衡分析是非常常見的內(nèi)容烛谊,同時(shí)也是關(guān)聯(lián)分析的基礎(chǔ)。在很多的遺傳進(jìn)化GWAS的文章中都會(huì)出現(xiàn)LD衰減或者block單倍型塊的圖嘉汰。那么什么是連鎖不平...
請問下染色體編號是一定是包含rs這樣的格式嗎
LD SCore計(jì)算基因多效性村斟、遺傳度贫导、遺傳相關(guān)性(the LD Score regression intercept, heritability and genetic correlation)這篇文章是對之前啊啊救救我,為何我的QQ圖那么飄(全基因組關(guān)聯(lián)分析)這篇文章的一個(gè)補(bǔ)坑蟆盹。 LD SCore除了查看顯著SNP位點(diǎn)對表型是否為基因多效性外孩灯,還額外補(bǔ)充了怎么計(jì)算...