一偏塞、序 目前對(duì)蛋白基因家族進(jìn)行分析主要有兩種方法盗扇，一基于同源性巍棱，二基于HMM模型。想要通過(guò)HMM模型預(yù)測(cè)蛋白基因家族缴守，首先得需要HMM模型數(shù)據(jù)。HMM模型可以從Pfam數(shù)據(jù)庫(kù)...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：寧夏
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基因家族：pfam數(shù)據(jù)庫(kù)下載基因家族的HMM模型 -
@恰好_fcc2 rmOutToGFF3.pl genome.fa.out > genome.fa.out.gff3 #使用RepeatMasker提供的rmOutToGFF3.pl 工具將結(jié)果轉(zhuǎn)化為gff3， 但是需要注意焚廊，這里的gff3不是標(biāo)準(zhǔn)的gff3
rmOutToGFF3.pl , 是Repeatmasker 軟件包里面有的腳本RepeatModeler安裝及使用
細(xì)節(jié)參閱RepeatModele官方文檔：http://www.repeatmasker.org/RepeatModeler/RepeatMasker和RepeatModel...
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RepeatModeler2.0＋RepeatMasker！习劫！!分享篇使用RepeatModeler2.0＋RepeatMasker 的時(shí)候咆瘟，嚴(yán)格按照命令跑程序，出現(xiàn)結(jié)果不如我意代碼： 出現(xiàn)的結(jié)果： 我想要的結(jié)果 原因：repeat...
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RepeatModeler2.0安裝及使用
RepeatModeler已更新诽里，擁有了一些新的功能袒餐，可以識(shí)別LTR的結(jié)構(gòu)在基因組注釋中第一步就是重復(fù)序列的屏蔽，目前常用的從頭注釋pipeline就是RepeatModel...
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conda報(bào)錯(cuò)Segmentation fault (core dumped)
今天安裝軟件時(shí)，發(fā)生報(bào)錯(cuò)匿乃，經(jīng)過(guò)查詢桩皿，可能是之前安裝過(guò)這個(gè)軟件，但是不成功幢炸，部分文件下載一半就結(jié)束了泄隔。軟件在conda用不了時(shí)，可clean一下重新安裝 所以將這些下載了一半的...
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Ubuntu18.04 將磁盤(pán)掛載在某目錄下情況說(shuō)明： 在安裝Ubuntu18.04的系統(tǒng)時(shí)宛徊，不小心將內(nèi)存分區(qū)了佛嬉，導(dǎo)致根目錄只用了其中的一個(gè)區(qū)，后面沒(méi)有內(nèi)存用了闸天，不想重新裝系統(tǒng)暖呕，遂想方法解決 解決方法 1.合并分區(qū) ...
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在使用ubuntu時(shí),不知道按到了哪里,文件夾的左側(cè)導(dǎo)航欄不見(jiàn)的問(wèn)題 現(xiàn)在是不見(jiàn)了解決方法有幾種: 1.F9 2.Shift + F9
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分享和錢(qián)有關(guān)的那些事湾揽，省錢(qián)、賺錢(qián)笼吟、存錢(qián)库物、錢(qián)生錢(qián)~
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2019.8月中旬開(kāi)始系統(tǒng)自學(xué)生信戚揭，<br>自學(xué)路漫漫索性報(bào)個(gè)班。<br><br>生信技能樹(shù)真的很棒撵枢！<br><br>這是我的一個(gè)學(xué)習(xí)筆記平臺(tái)民晒，點(diǎn)滴記錄。
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力
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R 報(bào)錯(cuò)
問(wèn)題1： Installation path not writeable, unable to update packages: boot, class, KernSmoot...
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CSS顏色代碼大全
R語(yǔ)言畫(huà)圖，自定義顏色绽慈，代碼http://www.mamicode.com/info-detail-1448036.html[http://www.mamicode.com/...
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常用的基因組數(shù)據(jù)庫(kù)匯總原文地址：http://www.360doc.com/content/18/0127/20/19913717_725596003.shtml[http://www.360do...
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綜述：人類對(duì)作物馴化基因組變異的影響
Title：Demography and its effects on genomic variation in crop domestication 原文鏈接 背景 ： 超...
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Aspera Connect恨旱，高速下載sra數(shù)據(jù)
一、下載安裝Aspera Connect Linux系統(tǒng)下的Aspera Connect安裝（Windows下的Aspera Connect安裝參考）坝疼。查看最新版本的Aspe...
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基因組共線性工具M(jìn)CScanXMCScanX一般是做基因組之間的共線性 一搜贤、MCScanX安裝 MCScanX官網(wǎng)http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/#tm下載MCSca...
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多序列比對(duì)并建樹(shù)－ClustalW1.安裝包 軟件使用： ClustalW 提供了兩種操作方式：1、鍵盤(pán)交互的菜單界面2钝凶、命令行方式由于命令行模式參數(shù)比較長(zhǎng)仪芒，看起來(lái)也比較復(fù)雜，我們主要介紹鍵盤(pán)交互的菜單界面運(yùn)...
