今天看到Plant physiology在線發(fā)表了一篇文章双藕。 In this study, we developed a software package, named Gr...
IP屬地：湖北
-
好好學(xué)！這技術(shù)值一篇Plant physiology放案！ -
@就在那里000 差別不大，兩個(gè)都有kite就挺舒服了烹棉，我的話…rstudio…
左手python右手R
寫(xiě)在前面 最近在學(xué)習(xí)python攒霹，結(jié)合一個(gè)實(shí)際案例，寫(xiě)一下python和R在做數(shù)據(jù)分析上的差異浆洗。本人還不是特別熟練python催束，所以python的代碼來(lái)自于kagle的一個(gè)高...
-
ggplot2繪制多樣性指數(shù)圖
今天繼續(xù)來(lái)進(jìn)行微生物多樣性的后續(xù)分析，來(lái)繪制多樣性指數(shù)圖伏社，喜歡的小伙伴可以在我的交流群中獲取本文代碼及數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì) 轉(zhuǎn)換數(shù)據(jù)格式計(jì)算simpson指數(shù) 數(shù)據(jù)可視化 添加實(shí)驗(yàn)...
-
左手python右手R
寫(xiě)在前面 最近在學(xué)習(xí)python抠刺，結(jié)合一個(gè)實(shí)際案例，寫(xiě)一下python和R在做數(shù)據(jù)分析上的差異摘昌。本人還不是特別熟練python速妖，所以python的代碼來(lái)自于kagle的一個(gè)高...
-
什么？你能在rstudio里寫(xiě)python聪黎？折騰reticulate 5分鐘后罕容，我逐漸了解了一切I have a R, I have a python 如果說(shuō)R語(yǔ)言對(duì)新人最友好的編譯器那一定是rstudio，在python上嘛……不好說(shuō)稿饰，我用過(guò)了pycharm锦秒，spyd...
-
插件 | 地表最強(qiáng) Hmmer Search 界面工具寫(xiě)在前面 從某個(gè)物種中鑒定某個(gè)家族的全部成員，一般有兩種操作： 基于Domain湘纵，用hmmsearch等軟件 基于序列相似性脂崔，用BLAST等軟件 事實(shí)上，我個(gè)人是推薦第二種梧喷，...
-
每天一個(gè)勸退小技巧
「TBtools Plugin」使用openBLAS或Apple''s BLAS是你的R矩陣運(yùn)算速度起飛
MacOS 12.0以后的系統(tǒng)更改了blas的位置砌左，具體去哪了現(xiàn)在不清楚脖咐，目前的辦法是brew安裝openblas，然后把openblas軟連接過(guò)去 問(wèn)題與思考 在寫(xiě)OneS...
-
不加地址是因?yàn)橛玫膒ython 基礎(chǔ)的包汇歹，另外他代碼里有g(shù)gplot 具體沒(méi)看是py 還是r下的屁擅。這人主要用py 批量glmm 模型，仔細(xì)一看調(diào)用的lme4产弹，有點(diǎn)蛋疼
跟著Nature Medicine學(xué)python：python調(diào)用R語(yǔ)言的包
看到了一篇數(shù)據(jù)和代碼都公開(kāi)的論文派歌，論文的題目是 Single-cell meta-analysis of SARS-CoV-2 entry genes across tiss...
-
不加地址是因?yàn)橛玫膒ython 基礎(chǔ)的包，另外他代碼里有g(shù)gplot 具體沒(méi)看是py 還是r下的痰哨。這人主要用py 批量glmm 模型胶果，仔細(xì)一看調(diào)用的lme4，有點(diǎn)脫褲子放屁……
跟著Nature Medicine學(xué)python：python調(diào)用R語(yǔ)言的包
看到了一篇數(shù)據(jù)和代碼都公開(kāi)的論文斤斧，論文的題目是 Single-cell meta-analysis of SARS-CoV-2 entry genes across tiss...
-
感興趣各種統(tǒng)計(jì)技巧撬讽，統(tǒng)計(jì)軟件蕊连，數(shù)據(jù)處理，問(wèn)卷分析和模型構(gòu)建游昼。<br><br>有心理學(xué)和醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)背景甘苍，有問(wèn)題請(qǐng)私信。
-
這么快就寫(xiě)好了
終止釋放-20210320 - Free烘豌！公益釋放 | 任何人都能分析 RNAseq 原始數(shù)據(jù)了载庭，只要你用 TBtools ！
寫(xiě)在前面 六年前廊佩，我著實(shí)開(kāi)發(fā) TBtools 的主要目的之一昧捷，即“減輕科研人員數(shù)據(jù)分析負(fù)擔(dān)”，而后慢慢變化成現(xiàn)在的“降低甚至拆除部分生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析門(mén)檻”罐寨∶一樱基于這三五年的觀...
-
過(guò)去說(shuō)complexheatmap太復(fù)雜，是我太菜了寫(xiě)在前面 之前曾抱怨過(guò)complexheatmap太復(fù)雜了鸯绿，現(xiàn)在我想說(shuō)是我太菜了跋破。折騰了一圈complexheatmap后，發(fā)現(xiàn)complexheatmap真的是極致全面的一...
-
我找個(gè)墻內(nèi)的地址
自拆機(jī)械表始
寫(xiě)在前面 春節(jié)期間跟家里人聊天的時(shí)候瓶蝴，再一次提到了小時(shí)候的時(shí)候拆家里手表的事毒返。然后又是對(duì)我一陣數(shù)落。孩童時(shí)的我對(duì)這個(gè)結(jié)構(gòu)復(fù)雜舷手、設(shè)計(jì)精巧的玩意充滿了好奇拧簸，總是想要機(jī)會(huì)拆開(kāi)看看里...
-
自拆機(jī)械表始寫(xiě)在前面 春節(jié)期間跟家里人聊天的時(shí)候，再一次提到了小時(shí)候的時(shí)候拆家里手表的事男窟。然后又是對(duì)我一陣數(shù)落盆赤。孩童時(shí)的我對(duì)這個(gè)結(jié)構(gòu)復(fù)雜贾富、設(shè)計(jì)精巧的玩意充滿了好奇，總是想要機(jī)會(huì)拆開(kāi)看看里...
-
生信、AI淑际、大數(shù)據(jù)畏纲、育種。MiyuanBiotech
-
ggplot2繪制經(jīng)典散點(diǎn)圖了解如何重現(xiàn)著名的gapminder散點(diǎn)圖 在本教程中春缕，您將學(xué)習(xí)如何再現(xiàn)由Hans Rosling[https://de.wikipedia.org/wiki/Hans_Ro...
-
1. 你把p3改成
p3<-ggplot()+
geom_rect(aes(xmin=5,xmax=12,ymin=-Inf,ymax=Inf),
fill="grey",alpha=0.3)+
geom_rect(aes(xmin=23,xmax=28,ymin=-Inf,ymax=Inf),
fill="grey",alpha=0.3)+
geom_rect(aes(xmin=35,xmax=52,ymin=-Inf,ymax=Inf),
fill="grey",alpha=0.3)+
geom_rect(aes(xmin=55,xmax=59,ymin=-Inf,ymax=Inf),
fill="grey",alpha=0.3)+
geom_line(df3,mapping = aes(x=x,y=y), size=1,color="#6994f3")
就能解決
2. 這個(gè)報(bào)錯(cuò)是因?yàn)閍nnotation不支持expression盗胀。圖沒(méi)啥問(wèn)題就別管了……
3. 最近在不同平臺(tái)上發(fā)現(xiàn)這個(gè)問(wèn)題，我的結(jié)論是macos下自帶抗鋸齒锄贼，win10下就沒(méi)有……跟著Nature Genetics學(xué)畫(huà)圖~ggplot2畫(huà)折線圖并在指定區(qū)域添加灰色背景
最近在看論文 Phased diploid genome assemblies and pan-genomes provide insights into the genet...
-
博士小姐姐牛皮读整！
『TBtools-plugin』OneStepWGCNA插件
這個(gè)插件已經(jīng)下架了，上架了更好用的WGCNA shiny：http://www.reibang.com/p/4691c535a522[https://www.jianshu...
-
公眾號(hào) R語(yǔ)言數(shù)據(jù)分析指南强品，歡迎大家關(guān)注
-
博士小姐姐????
『R腳本練習(xí)』dplyr各種join
在剛接觸用代碼行處理數(shù)據(jù)的時(shí)候膘侮，受到課題組的影響，是從shell入門(mén)的的榛，具體說(shuō)逃不過(guò)sed grep awk,在這之前我只會(huì)用excel下的函數(shù)琼了，excel下有個(gè)很好的垂直查...
