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limma function error
limma做差異分析分步運行時候沒有問題, 但是把步驟寫成function時一直報錯 一直以為是字符串傳遞的問題相赁，最后發(fā)現(xiàn)是因為沒有指定參數(shù)更改
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您好，請問Seurat的去批次是sce@data開始處理的萨脑，并不能得到去批次后的counts矩陣。我有個需求是得到去批次后的TPM矩陣饺饭，是不是需要換成MNN或者其他的去批次方法才可以渤早？麻煩了，謝謝~
Seurat3||整合方法merge()與IntegrateData()
隨著單細胞測序技術(shù)的成熟砰奕，越來越多的研究者選擇應(yīng)用該技術(shù)來闡釋手上的生物學(xué)問題蛛芥。同時單細胞也不再是單樣本單物種單器官的技術(shù)提鸟，往往會用到多樣本整合分析的技術(shù)军援，這方面Seurat...
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conda環(huán)境報錯： Solving environment: failed with initial frozen solve.
刷了機，安裝好conda環(huán)境后conda又瘋了称勋。conda install -y samtools hisat2 bowtie2 bwa htseq bowtie報錯開始 ...
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DNA鏈方向上的小疑惑
雖然是做生物信息的胸哥，但是經(jīng)常被一些基礎(chǔ)性概念所困擾……而我又是一個強迫癥，于是把這些亂七八糟的東西整理了一下赡鲜，強行寫了一篇小文章空厌。東西太雜，但是彼此相關(guān)银酬，實在想不到什么合適的...
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PCA計算原理（超簡單嘲更，R代碼）今天介紹如下三點內(nèi)容: PCA是如何計算的 如何計算每個PC所能解釋的方差 特征值與PC解釋方差比例的關(guān)系 1. 使用R語言自帶函數(shù)prcomp計算PCA 并計算每個PC所能...
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手畫綜合信號通路（部分）忽略矩形中的蛋白顏色，但不要忽略箭頭的顏色 均手工繪制揩瞪，通過查閱文獻還有KEGG綜合所畫赋朦，錯誤在所難免。可留言宠哄。參考文獻眾多壹将，不再一一列出。 ----------------...
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手畫綜合信號通路（部分）
忽略矩形中的蛋白顏色透揣，但不要忽略箭頭的顏色 均手工繪制济炎，通過查閱文獻還有KEGG綜合所畫，錯誤在所難免辐真⌒肷校可留言。參考文獻眾多侍咱，不再一一列出耐床。 ----------------...
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github 包本地安裝如果是安裝rPython，則需要安裝rtools和Python2.7楔脯， 將rPython壓縮包解壓到R library后撩轰，更改configure.win里面的python路徑...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
