哈嘍大家好,好久不見。因為疫情原因很多小伙伴們已經(jīng)居家辦公很久了,大家可能也在思考一個問題:在宅家期間沒有辦法做實驗的情況下给涕、如何利用公共數(shù)據(jù)庫做一些課題呢?今天和大家分享一...
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--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一個用于操作sam和bam文件的工具合集。能夠?qū)崿F(xiàn)二進(jìn)...
@NICE_AGIS 不可以哦衡怀,必須有生物學(xué)重復(fù)才能用這個方法,只有單樣本的話可以嘗試以下k-means聚類吧
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之時序分析(maSigPro包)在轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析過程中安疗,我們最常做的是不同處理方式的樣本之間的比較(Treated vs Control)抛杨,這時候我們采用“DEG分析+pathway分析”的方式就可基本完成...
@love倩_d1c3 確實放錯了,謝謝提醒荐类!
干貨 | 一文教會你如何分析ATAC-seq數(shù)據(jù)哈嘍大家好怖现,好久沒有跟新啦,小編最近面臨博士三年級畢業(yè)的壓力玉罐,所以公眾號都沒時間打理了真竖,不過偶爾還是能看到有人關(guān)注我的公眾號或者留言,還是很受鼓舞噠~所以還是想抽時間將之前學(xué)...
哈嘍恢共,大家好,好久不見璧亚,今日分享代碼如題——如何對fastq文件進(jìn)行批量處理讨韭?以RNAseq為例。首先大家可以回顧一下小編之前關(guān)于RNAseq數(shù)據(jù)分析的推送: 干貨 | 一文...
哈嘍大家好癣蟋,好久沒有跟新啦透硝,小編最近面臨博士三年級畢業(yè)的壓力,所以公眾號都沒時間打理了疯搅,不過偶爾還是能看到有人關(guān)注我的公眾號或者留言濒生,還是很受鼓舞噠~所以還是想抽時間將之前學(xué)...
哈嘍大家好,前面小編和大家分享了ATAC-seq數(shù)據(jù)分析的流程幔欧,那么罪治,ATAC-seq建庫是否也可以DIY呢丽声?下面就和大家分享一則ATAC-seq建庫的protocol吧~(...
轉(zhuǎn)錄組是指細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和是整。轉(zhuǎn)錄組測序(Transcriptome sequencing)是基于Illumina HiSeq測序平臺檢測細(xì)胞內(nèi)所...
在學(xué)習(xí)生物信息學(xué)的過程中,不可避免的會經(jīng)常接觸到Linux系統(tǒng)民假,畢竟生物信息學(xué)軟件大多都是基于Linux系統(tǒng)開發(fā)的浮入,尤其對于生物大數(shù)據(jù)的處理如原始FastQ數(shù)據(jù)的比對、組裝以...