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    單細(xì)胞分析之細(xì)胞交互-3:CellChat

    常用的細(xì)胞通訊軟件:CellphoneDB[http://www.reibang.com/p/38a9376f5286]:是公開的人工校正的蔑担,儲存受體牌废、配體以及兩種相互作用...

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    論文圖鑒20:單細(xì)胞自動注釋

    Automatic cell type identification methods for single-cell RNA sequencing - ScienceDire...

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    10X空間轉(zhuǎn)錄組聚類分析回顧之SpaGCN(結(jié)合基因表達(dá)信息番甩、空間位置和形態(tài)學(xué))

    隔離的第九天,孤獨(dú)仍在届搁,但亦師亦友缘薛,今天我們來回顧一下10X空間轉(zhuǎn)錄組聚類的分析軟件SpaGCN,這個軟件之前分享過卡睦,文章在10X空間轉(zhuǎn)錄組聚類分析之圖卷積網(wǎng)絡(luò)(graph ...

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    10X單細(xì)胞空間數(shù)據(jù)分析之表征細(xì)胞狀態(tài)和生態(tài)型(EcoTyper示例代碼)

    隔離的第四天宴胧,一個人的日子總是很難熬,孤獨(dú)的生活卻總是來到我的身邊么翰,這一篇我們來分享EcoTyper的示例代碼牺汤,幫助我們來尋找細(xì)胞特異性轉(zhuǎn)錄狀態(tài)和共關(guān)聯(lián)模式。這篇發(fā)表于cel...

  • 可關(guān)注公眾號:醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)(筆記在公眾號上更新)

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