1：在線構建RAxML樹 1. CIPRES網(wǎng)站： CIPRES Science Gateway V3.3[http://www.phylo.org/index.php/po...
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在線和本地兩種方法構建 RAxML 進化樹方法和解讀 -
【ProteoWizard MSConvert】質譜文件格式簡介及其轉換質譜格式 質譜文件格式多種多樣馒胆，各儀器廠商產(chǎn)出的數(shù)據(jù)都有不同雹舀。雖然HUPO已經(jīng)對質譜數(shù)據(jù)進行了標準化龄广，但大家依然是我行我素倦畅，因為不得不用它們提供的軟件唆香，而不同的軟件會要求不同...
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使用EGGNOG-Mapper對非模式物種快速進行GO或KEGG注釋對于非模式物種峡懈，需要做GO或KEGG富集查辩，可以嘗試使用EGGNOG-Mapper來對你的物種序列進行快速注釋。在注釋結果文件中撤蚊，可以同時獲得序列映射上的GO號或KO號古掏，直接提...
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Linux下miniconda的安裝使用
Anaconda與Miniconda的區(qū)別 Anaconda是一個打包的集合器皿损话，里面預裝好了conda侦啸、某個版本的python、眾多packages丧枪、科學計算工具等等光涂，所以...
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miniconda的常用命令匯總
寫這個的目的主要是年紀大了，老是記不住命令行拧烦，索性整理下來忘闻，忘了就不用滿世界找了。 和channels有關的命令 查看已經(jīng)添加的channels 增加channels 有時候...
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基因的可變剪切(alternative splicing)和蛋白異構體(Protein isoform)寫這個文章的原因是因為我在用Trinity組裝轉錄組的時候恋博，除去軟件的原因齐佳，在生物體內有很多的可變剪切現(xiàn)象私恬，定義就是一個mRNA前提可以通過不同的內含子出去方式獲得成熟的mR...
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如何區(qū)分基因的顯性效應(Dominance effect)和上位性效應(Epistatic effect)基因的上位性效應和顯性效應聽名字就覺得挺繞的，聽起來就是一個基因對另一個基因的壓制效果炼吴，網(wǎng)上的介紹看起來云里霧里本鸣，還搬來染色體，標記的性狀硅蹦，感覺更加復雜了荣德。 基因的顯性效應 ...
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建立者效應(founder effect)和瓶頸效應(bottleneck effect)我對種群遺傳學這塊一直不太熟悉，奈何實驗室中經(jīng)常有需要涉及到種群進化這塊的內容童芹，所以以下的這塊介紹涮瞻，大抵將給我自己聽的。 建立者效應 建立者效應是指少數(shù)個體的基因頻率決定了他...
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如何用fasq-dump解壓SRA文件
之前介紹了如何安裝sratoolkit, 可以看我之前寫的簡書http://www.reibang.com/p/188df05615c7[https://www.jians...
