測序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw r...
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TCGA數(shù)據(jù)差異分析后生存分析（批量單因素cox回歸/Lasso篩選采驻，多因素cox建模审胚，時間依賴ROC曲線及KM plot可視化） -
【R語言】三種批量做T檢驗的方法t檢驗相信大家應(yīng)該都不陌生。不管是大學(xué)里面的數(shù)理與統(tǒng)計礼旅，還是研究生階段的生物統(tǒng)計學(xué)膳叨，里面都會提到t檢驗。 小編也給大家總結(jié)過一些統(tǒng)計學(xué)相關(guān)的知識 ?統(tǒng)計學(xué)中數(shù)據(jù)分析方法匯總痘系！...
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R語言_split()函數(shù)用法
前言:微博參與話題 #給你四年時間你也學(xué)不會生信# Divide into Groups and Reassemble | 重新組合 函數(shù)split()可以按照分組因子菲嘴，把向...
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10X單細胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）進行細胞定義的分析策略hello，大家好汰翠，從今天開始龄坪，我們開始走上正軌，分享10X單細胞或者10X空間轉(zhuǎn)錄組的分析內(nèi)容复唤，今天我們分享的內(nèi)容就是做細胞定義的分析策略悉默，文章在Tutorial: gui...
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ComplexHeatmap復(fù)雜熱圖繪制學(xué)習(xí)——7.OncoPrintOncoPrint OncoPrint[http://www.cbioportal.org/faq#what-are-oncoprints]是一種通過熱圖可視化多個基因組變化...
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10X單細胞揭示腫瘤浸潤性T細胞的泛癌單細胞圖譜臨近年底了，再過幾天苟穆，就窮了一年了抄课，不知道是不是該珍惜現(xiàn)在窮的日子，因為以后肯定會更窮的雳旅，??跟磨。今天我們來分享一個T細胞方面的研究，當然主要還是針對腫瘤的攒盈，參考文章在Pan-c...
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KM生存分析如何取最佳的cutoffKM生存分析 如何取最佳cutoff KM生存分析中通常取中位值作為cutoff抵拘，但也并不一定是這樣 必要時可以選擇最佳的cutoff值，如何實現(xiàn)型豁？ ### survival...
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轉(zhuǎn)錄組分析5——差異表達分析差異表達分析內(nèi)容：? 基因表達量的標準化方法及可視化? counts僵蛛，RPKM，F(xiàn)PKM迎变，TPM? PCA圖充尉、熱圖等? 差異表達分析及可視化? limma-voom，edge...
