昨天我在單細(xì)胞天地講解了使用monocle2進(jìn)行擬時序分析的方法并闲，基本上跟著我的代碼走一波就可以學(xué)會了瞒爬，當(dāng)然具體參數(shù)理解需要自行發(fā)力哦，見：使用monocle做擬時序分析（單...
IP屬地：北京
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擬時序分析的熱圖提取基因問題 -
求問网持，這個和find.anchord的區(qū)別是什么??，剛學(xué)了這個函數(shù)，不明白，請教一下
單細(xì)胞多樣本整合（同批次）
單細(xì)胞前期工作重要的是如何將測序得到的多樣本整合同步分析： library(Seurat) folders=list.files('./') #列出文件夾 folders=f...
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所以怎么獲取呢??
點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn) | 真香谈秫！Simple GO GSEA 富集分析 ~
寫在前面 時間撥回去 2015年，那時我接觸生信已有一年鱼鼓，TBtools 開發(fā)尚在萌芽階段拟烫。那會，我寫了幾款小的軟件蚓哩，包括 “blast3go”，為的是應(yīng)對即將收費(fèi)的“bla...
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python抓韩，awk，shell格式化輸出內(nèi)容全解
話不多說鬓长，直接開始 python的格式化輸出 (一)用 {} 花括號 格式化的關(guān)鍵字是 .format(要格式化的內(nèi)容） eg： （二）%格式化操作 %s 替換的是所...
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這個世界流行離開涉波，但我們卻不擅長告別
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這個還真沒注意英上，這個readout代表什么。重復(fù)率啤覆？是測序結(jié)果不好嗎苍日？
數(shù)據(jù)分析2-.sra數(shù)據(jù)拆分與過濾
1.拆分 >fastq-dump --gzip --split-3 SRR6449842 2.fastqc質(zhì)量檢測 參考：https://zhuanlan.zhihu.com...
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@wo_monic 我已經(jīng)成功了
qsub任務(wù)提交系統(tǒng)
qsub系統(tǒng)適用于服務(wù)器集群的任務(wù)提交參考地址 qsub提交系統(tǒng)使用說明 運(yùn)行命令 qsub run.s PBS的walltime于qsub -a 的時間格式是不一樣的 #P...
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退出了交互式終端,如何再打開這個終端
PBS 作業(yè)管理系統(tǒng)
在上一篇中我們非常簡單地介紹了在 C 語言中嵌入 mpi4py 程序的方法。 前面我們所給出的各個例程一般都是在單臺計算機(jī)上直接使用 mpiexec 或 mpirun 執(zhí)行的...
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你好,提交R作業(yè)時,可以創(chuàng)建成為交互式的作業(yè),用類似于在R console終端操作的方式進(jìn)行操作嗎?
qsub任務(wù)提交系統(tǒng)
qsub系統(tǒng)適用于服務(wù)器集群的任務(wù)提交參考地址 qsub提交系統(tǒng)使用說明 運(yùn)行命令 qsub run.s PBS的walltime于qsub -a 的時間格式是不一樣的 #P...
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數(shù)據(jù)分析4.1-STAR_的簡單使用
1.構(gòu)建參考基因組的索引 1.1以小鼠的基因組為例窗声，首先下載參考基因組與基因組的注釋文件 wget http://ftp.ensembl.org/pub/release-10...
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數(shù)據(jù)分析3.1-stringtie 注釋新基因-鑒定lncRNA
stringtie -p 16 -G /apps/users/zebrafish/Danio_rerio/pkd2/Danio_rerio.GRCz11.102.gtf –B...
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數(shù)據(jù)分析2-.sra數(shù)據(jù)拆分與過濾1.拆分 >fastq-dump --gzip --split-3 SRR6449842 2.fastqc質(zhì)量檢測 參考：https://zhuanlan.zhihu.com...
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數(shù)據(jù)分析1-使用ascp下載高通量測序數(shù)據(jù).sra
1.下載安裝ascp相恃； win10現(xiàn)在可以安裝wsl，下載數(shù)據(jù)到本地非常方便笨觅。我使用的是Ubuntu 18.04.在特定目錄下載安裝ascp wget http://down...
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@春卷00 謝謝
坑隊友系列：ftp協(xié)議下載ensembl參考基因組
你問我為啥標(biāo)題這么長豆茫，據(jù)說是關(guān)鍵詞給的多侨歉，容易被搜到。寫得不好揩魂，不用海涵幽邓，直接提出，謝謝您吶~ 1. 前言： 沒錯火脉，作為一個自以為入門了的人其實還在門外牵舵。根據(jù)達(dá)克效應(yīng)圖解，充...
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@假裝挖金礦的獅毛 謝謝
clusterProfiler: 分析+可視化GO和KEGG富集的轉(zhuǎn)錄組R包
寫作之友 基因和基因簇的功能譜 (functional profiles) 的統(tǒng)計學(xué)分析及可視化 G Yu, LG Wang, Y Han, QY He. clusterPr...
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問一下 ensemble 中 基因組 rm sm以及沒有后綴的，三種情況分別是什么意思方援？求解Ｃ怀础！犯戏！
坑隊友系列：ftp協(xié)議下載ensembl參考基因組
你問我為啥標(biāo)題這么長送火，據(jù)說是關(guān)鍵詞給的多，容易被搜到先匪。寫得不好种吸，不用海涵，直接提出呀非，謝謝您吶~ 1. 前言： 沒錯坚俗，作為一個自以為入門了的人其實還在門外。根據(jù)達(dá)克效應(yīng)圖解岸裙，充...
