最近跑通了一遍GWAS分析贱迟，全程在linux操作冰评，雖然具體還有好多需要微調(diào)的地方噪生，先把代碼整理分享出來(lái)mark一下 前期準(zhǔn)備 1.理論知識(shí) 強(qiáng)烈推薦百邁客云課堂課程GWAS生...
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跑通GWAS剪撬，用這些腳本就夠了 -
科研工作者如何合理使用谷歌瀏覽器step1安裝谷歌瀏覽器step2下載谷歌上網(wǎng)助手（Ghelper）http://googlehelper.net/[http://googlehelper.net/]ste...
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使用CMplot包繪制環(huán)形曼哈度圖安裝并加載所需R包 基本用法 常用參數(shù) 加載并查看示例數(shù)據(jù) 基本數(shù)據(jù)格式： 前三列分別為SNP的名稱，所在染色體，SNP的位置，后面每列為不同性狀的P值模蜡，每個(gè)性狀單獨(dú)一列 默...
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每周文獻(xiàn) 2022-01-05大家好，本周給大家分享的是2021年12月份發(fā)表在Current biology上與中國(guó)家馬體型相關(guān)主效基因突變的一篇文章扁凛。 文章題目：A single-nucleotide...
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使用GEMMA進(jìn)行復(fù)雜性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)GEMMA（Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm）是一款基于混合線性模型的GWAS分析軟件（文獻(xiàn)信息...
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R數(shù)據(jù)可視化3: 直方/條形圖什么是直方/條形圖忍疾？ 直方圖（Histograms）和條形圖（Barchart）看起來(lái)沒(méi)有什么區(qū)別，長(zhǎng)得很像谨朝，但是這兩個(gè)并不同一種統(tǒng)計(jì)圖像卤妒。具體地，通常直方圖用來(lái)描述連續(xù)型數(shù)...
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R語(yǔ)言繪制頻率直方圖
頻率直方圖是數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)中經(jīng)常會(huì)用到的圖形展示方式字币，同時(shí)在生物學(xué)分析中可以更好的展示表型性狀的數(shù)據(jù)分布類型则披；R基礎(chǔ)做圖中的hist函數(shù)對(duì)單一數(shù)據(jù)的展示很方便，但是當(dāng)遇到多組數(shù)據(jù)的...
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測(cè)序原理：一代二代三代測(cè)序原理詳解1. 一代測(cè)序(Sanger sequencing) 雙脫氧鏈終止法采用DNA復(fù)制原理洗出。 Sanger測(cè)序反應(yīng)體系中包括目標(biāo)DNA片段士复、脫氧三磷酸核苷酸（dNTP）、雙脫氧三...
