最近跑通了一遍GWAS分析狗热,全程在linux操作发侵,雖然具體還有好多需要微調(diào)的地方辐宾,先把代碼整理分享出來mark一下 前期準(zhǔn)備 1.理論知識(shí) 強(qiáng)烈推薦百邁客云課堂課程GWAS生...
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step1安裝谷歌瀏覽器step2下載谷歌上網(wǎng)助手(Ghelper)http://googlehelper.net/[http://googlehelper.net/]ste...
輸入文件每一列信息在哪找
使用CMplot包繪制環(huán)形曼哈度圖安裝并加載所需R包 基本用法 常用參數(shù) 加載并查看示例數(shù)據(jù) 基本數(shù)據(jù)格式: 前三列分別為SNP的名稱,所在染色體灶挟,SNP的位置琉朽,后面每列為不同性狀的P值,每個(gè)性狀單獨(dú)一列 默...
安裝并加載所需R包 基本用法 常用參數(shù) 加載并查看示例數(shù)據(jù) 基本數(shù)據(jù)格式: 前三列分別為SNP的名稱稚铣,所在染色體箱叁,SNP的位置墅垮,后面每列為不同性狀的P值,每個(gè)性狀單獨(dú)一列 默...
大家好若河,本周給大家分享的是2021年12月份發(fā)表在Current biology上與中國(guó)家馬體型相關(guān)主效基因突變的一篇文章。 文章題目:A single-nucleotide...
GEMMA(Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm)是一款基于混合線性模型的GWAS分析軟件(文獻(xiàn)信息...
什么是直方/條形圖饲窿? 直方圖(Histograms)和條形圖(Barchart)看起來沒有什么區(qū)別,長(zhǎng)得很像焕蹄,但是這兩個(gè)并不同一種統(tǒng)計(jì)圖像逾雄。具體地,通常直方圖用來描述連續(xù)型數(shù)...
頻率直方圖是數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)中經(jīng)常會(huì)用到的圖形展示方式腻脏,同時(shí)在生物學(xué)分析中可以更好的展示表型性狀的數(shù)據(jù)分布類型鸦泳;R基礎(chǔ)做圖中的hist函數(shù)對(duì)單一數(shù)據(jù)的展示很方便,但是當(dāng)遇到多組數(shù)據(jù)的...
1. 一代測(cè)序(Sanger sequencing) 雙脫氧鏈終止法采用DNA復(fù)制原理钥平。 Sanger測(cè)序反應(yīng)體系中包括目標(biāo)DNA片段、脫氧三磷酸核苷酸(dNTP)姊途、雙脫氧三...
PLINK語法體驗(yàn) by張成龍 郵箱:yianquanwl@qq.com[mailto:yianquanwl@qq.com] 該教程參考鄧飛博客與自己總結(jié) plink軟件是G...